Question

我正在处理.nc文件中组织的气候数据的日常观察。我使用光栅包的stack命令读取它们。每个文件（对应一年）都是具有以下特征的RasterStack元素：

class       : RasterStack 
dimensions  : 360, 720, 259200, 365  (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution  : 0.5, 0.5  (x, y)
extent      : -180, 180, -90, 90  (xmin, xmax, ymin, ymax)

每一层都是一天价值的栅格我想总结各层，以计算月度值。我相信解决方案应该使用calc或stackApply {raster}，但我找不到从第x层到第y层求和的方法，或者在求和之前将RasterStack子集化的方法。

我准备了example file只有12层（以减小尺寸）。

我不知道如何提出代码，抱歉，但它应该是这样的：

library(raster)
setwd("myfolder")
data<-stack(mydata.nc)

datasum<- stackApply(data, ??? ,fun=sum)

谢谢

Answer 1

您可以使用stackApply执行此操作。使用示例数据，看起来每个栅格图层的名称都是日期。您可以使用它来构建需要传递给stackApply的索引。

指数列表需要在1月份的日子里有31个等等。

你可以这样做：

    #get the date from the names of the layers and extract the month
    indices <- format(as.Date(names(data), format = "X%Y.%m.%d"), format = "%m")
    indices <- as.numeric(indices)

    #sum the layers
    datasum<- stackApply(data, indices, fun = sum)

结果将是12层的光栅堆栈。

要从堆栈中对栅格图层进行子集化，您可以执行data[[c(1,2]]

Answer 2

我遇到了同样的问题，要计算长时间序列的.nc文件的平均值，但是stackApply对我不起作用。

我设法使用calc解决了问题。因此，您还可以使用：

#sum the layers
datasum <- calc(data,fun=function(x) { by(x, indices, sum)})

R

2 个答案: