我有一系列用于执行多个数据步骤的R脚本
我需要的分析。其中一些需要很长时间才能真正创造
大物件。我注意到，如果我只是连续地（通过main.R脚本）获取所有这些内容，那么
对于后续步骤的处理比我输出一个脚本需要更长的时间，保存
我需要什么，并重新启动R进行下一步（加载我需要的数据）。
我想知道是否有
方式，也许通过Rscript或Bash脚本，我可以执行此操作。
需要有前两个脚本持续存在的对象（加载
我的外部数据并创建将用于所有进一步的对象
脚步）。我想我也可以保存它们并将它们加载到更多的脚本中。
（我还希望将一些命名参数传递给这个脚本，我认为我可以在其他SO帖子上找到它，并且可以使用类似optparse的内容。）
因此，我认为脚本看起来像这样：
#! /bin/bash
Rscript 01_load.R # Objects would persist, ideally
Rscript 02_create_graphs.R # Objects would persist, ideally
Rscript 03_random_graphs.R # contains code to save objects
#exit R
Rscript 04_permutation_analysis.R # would have to contain code to load data
#exit
等等。这个问题有方法解决吗？我在64位CentOS 6上使用R 3.2.2。谢谢。
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克里斯，
听起来你应该使用gc()和rm()在你的步骤之间（或之内）做一些人工管理。有关详细信息，请参阅help(gc)和help(rm)。
因此，您可以执行以下操作，而不是退出R并重新启动它：
rm(list = ls())
gc()
但请注意：rm(list = ls())会丢弃所有物品。最好创建一个合适的对象列表，并将其放在rm()。