Question

[原帖]

我见过几个类似的SO问题，但我认为其中任何一个都与操作系统无关。

长话短说，这是我在尝试建立与Redshift的ssl连接时所看到的。

library(RPostgreSQL)
drv <- dbDriver("PostgreSQL")
con <- dbConnect(drv,
                 host = "XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com",
                 port = 5439,
                 user = "XXXXXXXX",
                 password = "XXXXXXXX",
                 dbname = "db1")

> Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : 
    RS-DBI driver: (could not connect XXXXXXXX@XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com on dbname "db1")

我尝试了以下操作，但没有一个工作。

Connect to Redshift via SSL using R
Importing files from PostgreSQL to R
Connect to Postgres via SSL using R
https://groups.google.com/forum/#!topic/rpostgresql-dev/ELnVUJqjDbk

我在AWS中有一个EC2节点（Ubuntu），办公室里有另一台Mac Pro，所以我尝试使用相同的代码从两者连接。

Linux系统适用于复制＆amp;粘贴完全相同的代码。这是Linux服务器上的Sys.info()：

sysname                                              Linux
release                                  3.13.0-48-generic
version        #80-Ubuntu SMP Thu Mar 12 11:16:15 UTC 2015
nodename                                   ip-xx-xxx-xx-xx
machine                                             x86_64
login                                              unknown
user                                                  bcui
effective_user                                        bcui

但是，Mac Pro失败并显示完全相同的错误消息。这是Mac Sys.info()（与我的Mac笔记本电脑相同）：

sysname                                             Darwin
release                                             15.3.0
version                      Darwin Kernel Version 15.3.0:
                             Thu Dec 10 18:40:58 PST 2015;
                       root:xnu-3248.30.4~1/RELEASE_X86_64
nodename                                    bcui-MBP.local
machine                                             x86_64
login                                                 bcui
user                                                  bcui
effective_user                                        bcui

我想知道导致此错误消息的Mac和Linux配置之间会有什么不同？

[更新2016/02/10]

我尝试卸载R和所有相关文件，然后从自制程序重新安装R：

brew tap homebrew/science
brew install R

相同的错误消息：

> Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : 
    RS-DBI driver: (could not connect XXXXXXXX@XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com on dbname "db1")

仅供参考，我可以使用相同的代码连接到其他非ssl Redshift集群，因此它可能与Mac上的openssl相关。

[更新2016/02/11]

来自@ MasashiMiyazaki的更多信息评论：

我已通过CLI使用psql进行连接，并且工作正常。此外，我还可以使用Python模块psycopg2成功连接。但是，我必须从.bash_profile 停用这一行才能使其正常工作：

export DYLD_LIBRARY_PATH=/usr/lib:$DYLD_LIBRARY_PATH

Answer 1

在这里黑暗中拍摄。你试过RPostgres吗？

像这样安装

# install.packages("devtools")
devtools::install_github("RcppCore/Rcpp")
devtools::install_github("rstats-db/DBI")
devtools::install_github("rstats-db/RPostgres")

然后测试出来

library(DBI)
library(RPostgres)

con <- dbConnect(RPostgres::Postgres(),
           host = "XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com",
           port = 5439,
           user = "XXXXXXXX",
           password = "XXXXXXXX",
           dbname = "db1")

在Mac 10.11.3上使用RPostgreSQL将R连接到Redshift

1 个答案: