Pandas DataFrame能否有效地计算PMI(Pointwise Mutual Information)?

时间:2016-03-07 17:55:00

标签: python pandas dataframe entropy

我环顾四周,并且令人惊讶的是没有找到一个简单的框架或现有代码用于计算Pointwise互信息(Wiki PMI),尽管像Scikit-learn这样的库为整体互信息提供了一个度量标准(通过直方图)。这是在Python和Pandas的背景下!

我的问题:

我有一个DataFrame,每行有一系列[x,y]示例,并希望根据公式(或更简单的公式)计算一系列PMI值:

PMI(x, y) = log( p(x,y) / p(x) * p(y) )

到目前为止,我的方法是:

def pmi_func(df, x, y):
    df['freq_x'] = df.groupby(x).transform('count')
    df['freq_y'] = df.groupby(y).transform('count')
    df['freq_x_y'] = df.groupby([x, y]).transform('count')
    df['pmi'] = np.log( df['freq_x_y'] / (df['freq_x'] * df['freq_y']) )

这会给出有效和/或有效的计算吗?

样本I / O:

x  y  PMI
0  0  0.176
0  0  0.176
0  1  0

2 个答案:

答案 0 :(得分:8)

我会添加三位。

def pmi(dff, x, y):
    df = dff.copy()
    df['f_x'] = df.groupby(x)[x].transform('count')
    df['f_y'] = df.groupby(y)[y].transform('count')
    df['f_xy'] = df.groupby([x, y])[x].transform('count')
    df['pmi'] = np.log(len(df.index) * df['f_xy'] / (df['f_x'] * df['f_y']) )
    return df
  1. df.groupby(x)[x].transform('count')df.groupby(y)[y].transform('count')应该仅限于使用 伯爵已经退缩了。
  2. np.log(len(df.index) * df['f_xy'] / (df['f_x'] * df['f_y'])要使用的概率。
  3. 处理数据帧的副本,而不是修改输入数据帧。

答案 1 :(得分:0)

解决方案(也包括SKlearn KDE替代方案):

请评论审核

$('#example').jQCloud(words,{
    shape : 'rectangle',
    afterCloudRender : function(){
        $('span','#example').each(function(){
            alert($(this).text());
        });
    }
});