使用Macro在FIJI上打开.im文件(nanoSIMS数据)

时间:2016-03-08 07:52:09

标签: plugins macros imagej

我正在寻找一个宏命令来打开FIJI中的.im文件。

由于FIJI不支持.im格式,它需要一个名为OpenMIMS的插件,但需要简单的行:

run("Open MIMS Image"); 
open(" directory ");

会给出错误消息:

  

文件不支持格式,阅读器插件不可用,或者找不到。

这里显然已经提出并解决了几乎相同的问题 - Problems with an ImageJ plugin,除了我已经使用FIJI和Bio-Formats不能解决我的问题,因为它似乎也不支持.im文件。

如果有人能够启发我,我将非常感激。 =)

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您应首先检查是否可以通过插件>使用菜单打开文件。打开MIMS图像。 (我假设您安装了OpenMIMS插件according to these instructions,添加了更新站点。)

macro recorder运行时执行此操作时,它应记录在宏代码中使用的必要命令。

在您发布的行中,第二行:

open(" directory ");

没有任何意义,它本身会导致您发布的错误消息(查看错误消息的第二部分,找出ImageJ尝试打开的路径)。