如何增加环形图中的半径

时间:2016-03-17 17:13:49

标签: r plot circlize

我使用circlize包绘制了以下图表。红色圆圈是之后绘制的单位圆,使用plotrix。我想绘制红色单位圆外的第一个轨道。出于这个原因,我将canvas.xlimcanvas.ylim更改为c(-1.2, 1.2)。但是,这不起作用。有关如何增加circlize图的圆半径的任何想法吗?

注意:或者,如果曲目在单位圆圈之外而不是在内部,那对我来说就足够了。

enter image description here

library(circlize)
set.seed(2)
n = 10
a = data.frame(factor = "dummy",
               x = rnorm(n, 100, sd=10))
circos.par(track.height = 0.2,
           canvas.xlim=c(-1.2, 1.2),   # bigger canvas?
           canvas.ylim=c(-1.2, 1.2))   # bigger canvas?
circos.initialize(factors = a$factor, 
                  x = a$x, xlim = c(0, 360))

lim <- c(-1.2, 1.2)
plot(NULL, asp=1, xlim=lim, ylim=lim)
circos.trackHist(a$factor, a$x, col = "blue", bg.col = grey(.95))
plotrix::draw.circle(0,0,1, border="red", lwd=2)  # unit circle

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我不知道如何调整xlimylim以使两个图适合。但是,如果您只想将红色圆圈放在轨道内,则可以直接使用draw.sector()功能:

circos.initialize(factors = a$factor, 
                  x = a$x, xlim = c(0, 360))
circos.trackHist(a$factor, a$x, col = "blue", bg.col = grey(.95))
draw.sector(0, 360, rou1 = circlize:::get_most_inside_radius(),
    border = "red")

此处circlize:::get_most_inside_radius()返回最后一个曲目的底部边框与圆心的距离。