将2D numpy数组转换为结构化数组

时间:2010-09-01 23:34:24

标签: python numpy

我正在尝试将二维数组转换为带有命名字段的结构化数组。我希望2D数组中的每一行都是结构化数组中的新记录。不幸的是,我所尝试的并没有按照我的预期工作。

我开始时:

>>> myarray = numpy.array([("Hello",2.5,3),("World",3.6,2)])
>>> print myarray
[['Hello' '2.5' '3']
 ['World' '3.6' '2']]

我想转换成这样的东西:

>>> newarray = numpy.array([("Hello",2.5,3),("World",3.6,2)], dtype=[("Col1","S8"),("Col2","f8"),("Col3","i8")])
>>> print newarray
[('Hello', 2.5, 3L) ('World', 3.6000000000000001, 2L)]

我尝试了什么:

>>> newarray = myarray.astype([("Col1","S8"),("Col2","f8"),("Col3","i8")])
>>> print newarray
[[('Hello', 0.0, 0L) ('2.5', 0.0, 0L) ('3', 0.0, 0L)]
 [('World', 0.0, 0L) ('3.6', 0.0, 0L) ('2', 0.0, 0L)]]

>>> newarray = numpy.array(myarray, dtype=[("Col1","S8"),("Col2","f8"),("Col3","i8")])
>>> print newarray
[[('Hello', 0.0, 0L) ('2.5', 0.0, 0L) ('3', 0.0, 0L)]
 [('World', 0.0, 0L) ('3.6', 0.0, 0L) ('2', 0.0, 0L)]]

这两种方法都试图将myarray中的每个条目转换为具有给定dtype的记录,因此插入了额外的零。我无法弄清楚如何将每行转换为记录。

另一次尝试:

>>> newarray = myarray.copy()
>>> newarray.dtype = [("Col1","S8"),("Col2","f8"),("Col3","i8")]
>>> print newarray
[[('Hello', 1.7219343871178711e-317, 51L)]
 [('World', 1.7543139673493688e-317, 50L)]]

此时不执行实际转换。内存中的现有数据只是被重新解释为新的数据类型。

我正在从文本文件中读入我正在开始的数组。数据类型未提前知道,因此我无法在创建时设置dtype。我需要一个高性能和优雅的解决方案,这个解决方案适用于一般情况,因为我会为很多种应用做很多次这种类型的转换。

谢谢!

5 个答案:

答案 0 :(得分:27)

您可以使用numpy.core.records.fromarrays“从(平面)数组列表创建记录数组”,如下所示:

>>> import numpy as np
>>> myarray = np.array([("Hello",2.5,3),("World",3.6,2)])
>>> print myarray
[['Hello' '2.5' '3']
 ['World' '3.6' '2']]


>>> newrecarray = np.core.records.fromarrays(myarray.transpose(), 
                                             names='col1, col2, col3',
                                             formats = 'S8, f8, i8')

>>> print newrecarray
[('Hello', 2.5, 3) ('World', 3.5999999046325684, 2)]

我试图做类似的事情。我发现当numpy从现有的2D数组(使用np.core.records.fromarrays)创建一个结构化数组时,它会将二维数组中的每一列(而不是每一行)视为记录。所以你必须转置它。 numpy的这种行为似乎不太直观,但也许有充分的理由。

答案 1 :(得分:9)

我想

new_array = np.core.records.fromrecords([("Hello",2.5,3),("World",3.6,2)],
                                        names='Col1,Col2,Col3',
                                        formats='S8,f8,i8')

是你想要的。

答案 2 :(得分:3)

“记录数组”和“结构化数组”之间存在很多混淆。这是我对结构化数组的简短解决方案。

dtype = np.dtype([("Col1","S8"),("Col2","f8"),("Col3","i8")])
myarray = np.array([("Hello",2.5,3),("World",3.6,2)], dtype=dtype)
np.array(np.rec.fromarrays(myarray.transpose(), names=dtype.names).astype(dtype=dtype).tolist(), dtype=dtype)

因此,假设已定义dtype,这是一个单行代码。

答案 3 :(得分:2)

如果数据以元组列表的形式开始,那么直接创建结构化数组:

OnTabSelectListener

这里的复杂性是元组列表已经变成了一个二维字符串数组:

In [228]: alist = [("Hello",2.5,3),("World",3.6,2)]
In [229]: dt = [("Col1","S8"),("Col2","f8"),("Col3","i8")]
In [230]: np.array(alist, dtype=dt)
Out[230]: 
array([(b'Hello',  2.5, 3), (b'World',  3.6, 2)], 
      dtype=[('Col1', 'S8'), ('Col2', '<f8'), ('Col3', '<i8')])

我们可以使用众所周知的In [231]: arr = np.array(alist) In [232]: arr Out[232]: array([['Hello', '2.5', '3'], ['World', '3.6', '2']], dtype='<U5') 方法来转置&#39;这个数组 - 实际上我们想要一个双转置:

zip*

In [234]: list(zip(*arr.T)) Out[234]: [('Hello', '2.5', '3'), ('World', '3.6', '2')] 方便地为我们提供了一个元组列表。现在我们可以使用所需的dtype重新创建数组:

zip

接受的答案使用In [235]: np.array(_, dtype=dt) Out[235]: array([(b'Hello', 2.5, 3), (b'World', 3.6, 2)], dtype=[('Col1', 'S8'), ('Col2', '<f8'), ('Col3', '<i8')])

fromarrays

在内部,In [236]: np.rec.fromarrays(arr.T, dtype=dt) Out[236]: rec.array([(b'Hello', 2.5, 3), (b'World', 3.6, 2)], dtype=[('Col1', 'S8'), ('Col2', '<f8'), ('Col3', '<i8')]) 采用常见的fromarrays方法:创建目标数组,并按字段名复制值。实际上它确实:

recfunctions

答案 4 :(得分:1)

好吧,我一直在努力解决这个问题,但是我找到了一种不需要太多努力的方法。如果这段代码“脏”,我道歉....

让我们从2D数组开始:

mydata = numpy.array([['text1', 1, 'longertext1', 0.1111],
                     ['text2', 2, 'longertext2', 0.2222],
                     ['text3', 3, 'longertext3', 0.3333],
                     ['text4', 4, 'longertext4', 0.4444],
                     ['text5', 5, 'longertext5', 0.5555]])

所以我们最终得到一个包含4列和5行的2D数组:

mydata.shape
Out[30]: (5L, 4L)

要使用numpy.core.records.arrays - 我们需要提供输入参数作为数组列表,所以:

tuple(mydata)
Out[31]: 
(array(['text1', '1', 'longertext1', '0.1111'], 
      dtype='|S11'),
 array(['text2', '2', 'longertext2', '0.2222'], 
      dtype='|S11'),
 array(['text3', '3', 'longertext3', '0.3333'], 
      dtype='|S11'),
 array(['text4', '4', 'longertext4', '0.4444'], 
      dtype='|S11'),
 array(['text5', '5', 'longertext5', '0.5555'], 
      dtype='|S11'))

这会为每行数据生成一个单独的数组BUT,我们需要输入数组按列,所以我们需要的是:

tuple(mydata.transpose())
Out[32]: 
(array(['text1', 'text2', 'text3', 'text4', 'text5'], 
      dtype='|S11'),
 array(['1', '2', '3', '4', '5'], 
      dtype='|S11'),
 array(['longertext1', 'longertext2', 'longertext3', 'longertext4',
       'longertext5'], 
      dtype='|S11'),
 array(['0.1111', '0.2222', '0.3333', '0.4444', '0.5555'], 
      dtype='|S11'))

最后它需要是一个数组列表,而不是一个元组,所以我们将上面的内容包装在list()中,如下所示:

list(tuple(mydata.transpose()))

这是我们的数据输入参数排序....接下来是dtype:

mydtype = numpy.dtype([('My short text Column', 'S5'),
                       ('My integer Column', numpy.int16),
                       ('My long text Column', 'S11'),
                       ('My float Column', numpy.float32)])
mydtype
Out[37]: dtype([('My short text Column', '|S5'), ('My integer Column', '<i2'), ('My long text Column', '|S11'), ('My float Column', '<f4')])

好的,现在我们可以将它传递给numpy.core.records.array():

myRecord = numpy.core.records.array(list(tuple(mydata.transpose())), dtype=mydtype)

......和手指交叉:

myRecord
Out[36]: 
rec.array([('text1', 1, 'longertext1', 0.11110000312328339),
       ('text2', 2, 'longertext2', 0.22220000624656677),
       ('text3', 3, 'longertext3', 0.33329999446868896),
       ('text4', 4, 'longertext4', 0.44440001249313354),
       ('text5', 5, 'longertext5', 0.5554999709129333)], 
      dtype=[('My short text Column', '|S5'), ('My integer Column', '<i2'), ('My long text Column', '|S11'), ('My float Column', '<f4')])

瞧!您可以按列名索引,如下所示:

myRecord['My float Column']
Out[39]: array([ 0.1111    ,  0.22220001,  0.33329999,  0.44440001,  0.55549997], dtype=float32)

我希望这会有所帮助,因为我浪费了很多时间numpy.asarray和mydata.astype等尝试让这个工作在最终解决这个方法之前。