Question

我有一个R软件包，我试图在MAC OS（yosemite）上安装，我收到链接器问题。这是我得到的错误

clang++ -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o File1.so File2.o File3.o File4.o RcppExports.o Utils.o -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -lRlapack -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -lRblas -L/usr/local/lib/gcc/x86_64-apple-darwin13.0.0/4.8.2 -lgfortran -lquadmath -lm -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation

ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/gcc/x86_64-apple-darwin13.0.0/4.8.2'
ld: library not found for -lgfortran
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make: *** [mypackage.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘mypackage’

我的Makevars文件包含：

PKG_LIBS = $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

在DESCRIPTION中，我有：

Depends:
    R (>= 3.2.0),
    Rcpp,
    RcppArmadillo
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

在R/help.R，我有：

#' @importFrom Rcpp evalCpp
#' @import RcppArmadillo
#' @useDynLib mypackage
NULL

这与此question不同，因为我已将Armadillo依赖项包含在其他.cpp文件所隐藏的头文件中：

#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <cmath>
#include <Rmath.h>
#include <RcppArmadillo.h>

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

我错过了什么吗？是否应该修改makefile？

Answer 1

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curl -O http://r.research.att.com/libs/gfortran-4.8.2-darwin13.tar.bz2
sudo tar fvxz gfortran-4.8.2-darwin13.tar.bz2 -C /

耗时更多：

使用homebrew或macports抓取包含gcc的{{1}}。更改gfortran。（有关使用~/.R/Makevars的gfortran安装的更多详细信息，请参阅openmp帖子。）

请参阅：

RcppArmadillo：在Mac上安装软件包时出错

1 个答案: