jNeuroML在生成的NEURON .MOD / NMODL中放置LEMS命令在哪里？

Question

LEMS中的以下标记如何映射到NEURON .MOD / NMODL文件中：

<OnEvent>
   <StateAssignment .. />
</OnEvent>

<OnCondition ... >
   <StateAssignment ... >
</OnCondition>

<DerivedVariable .. />
<ConditionalDerivedVariable .. />
<TimeDerivative .. />

Answer 1

LEMS标签映射到NEURON MOD，如下所示：

• OnEvent - ＆gt; NET_RECEIVE ：StateAssignment内的OnEvent被放入NEURON .MOD的NET_RECEIVE块中。分配按照它们在LEMS文件中的显示顺序放置。
• OnCondition - ＆gt; BREAKPOINT ：每个if标记中的所有OnCondition语句都聚集在一起并置于BREAKPOINT部分，并按照它们在LEMS文件中的显示顺序执行。
• DerivedVariable，ConditionalDerivedVariable，TimeDerivative - ＆gt; DERIVATIVE ：这些也聚集在一起并出现在DERIVATIVE部分。首先是所有DerivedVariable语句，然后是所有ConditionalDerivedVariable语句，最后是所有TimeDerivative语句。和其他人一样，它们都按照它们出现的顺序放置。

注意：

• 如果您需要DerivedVariable使用的OnCondition，请使用OnCondition创建始终正在执行的 test="1 .eq. 1"语句，新的StateVariable，并将其放在将使用它的任何其他OnCondition语句之前。
• 同样，如果您需要DerivedVariable取决于ConditionalDerivedVariable，请创建一个始终执行的ConditionalDerivedVariable并将其放在使用它的其他ConditionalDerivedVariable之前。

• 一旦翻译成NEURON MOD，语句将按照以下顺序在每个时间步长内进行分组和执行：

  1. OnEvent
  2. OnCondition的
  3. DerivedVariable的
  4. ConditionalDerivedVariable的
  5. TimeDerivative的

请参阅：In NEURON .MOD files what is the order of operations of the sections?