我正在尝试使用sed来执行此操作：
我有一个空格分隔的文件，有5列，如下所示：
45_342 2 SEQUENCE_2 A G
234_43 45 SEQUENCE_45 T G
12_45 9 SEQUENCE_9 C C
1233_456 134 SEQUENCE_134 T A
我正在尝试将每行中的字符串“SEQUENCE”替换为在同一行开头找到的模式。我应该获得：
45_342 2 45_342_2 A G
234_43 45 234_43_45 T G
12_45 9 12_45_9 C C
1233_456 134 1233_456_134 T A
我尝试将此逻辑与以下sed命令一起使用：
sed -i '/PatternAtBeginnigOfLine/s/SEQUENCE/PatternAtBeginnigOfLine/g' ./file
我的sed代码如下：
sed -i '/^[0-9]\+_[0-9]\+\s/s/SEQUENCE/^[0-9]\+_[0-9]\+/g' ./file
但是我最终得到了这个结果
45_342 2 ^[0-9]\+_[0-9]\+_2 A G
234_43 45 ^[0-9]\+_[0-9]\+_45 T G
12_45 9 ^[0-9]\+_[0-9]\+_9 C C
1233_456 134 ^[0-9]\+_[0-9]\+_134 T A
对于我所做错的任何建议都将不胜感激。
答案 0 :(得分：1)
sed解决方案$ sed -E 's/([^ ]+) ([^ ]+) SEQUENCE/\1 \2 \1/' ./file
45_342 2 45_342_2 A G
234_43 45 234_43_45 T G
12_45 9 12_45_9 C C
1233_456 134 1233_456_134 T A
或者，要更改文件，请添加-i选项：
sed -i -E 's/([^ ]+) ([^ ]+) SEQUENCE/\1 \2 \1/' ./file
s（替换）命令的格式为s/old/new/。在我们的例子中，old模式包括：
([^ ]+) ([^ ]+) SEQUENCE
由于括号，它会捕获第1组中的第一列和第2组中的第二列。
new文字如下：
\1 \2 \1
这意味着匹配的文本将替换为第一个组，表示为\1，一个空格，第二个组，表示为\2，一个空格，以及第一个组。
注意：
我添加了-E标志，告诉sed使用扩展正则表达式。这避免了需要大量的反斜杠转义。
由于我们希望每行只执行一次此替换，因此替换命令不需要g修饰符
awk解决方案为了完整起见，这是一个使用awk的解决方案：
$ awk '{sub("SEQUENCE", $1, $3)} 1' file
45_342 2 45_342_2 A G
234_43 45 234_43_45 T G
12_45 9 12_45_9 C C
1233_456 134 1233_456_134 T A
要就地更改文件（假设你有一个现代的GNU awk）：
awk -i inplace '{sub("SEQUENCE", $1, $3)} 1' file
sub("SEQUENCE", $1, $3)
这会在第三个字段中查找SEQUENCE（表示为$3）。如果找到，则将其替换为第一个字段（表示为$1）。
1
这是用于打印线的awk简洁速记。
答案 1 :(得分：0)
这是一个小的Bash脚本：
while read -r col0 col1 col2 rest; do
printf "%s %s %s %s\n" "$col0" "$col1" "${col2/SEQUENCE/$col0}" "$rest"
done < infile
while read -r ...; do ... done < infile循环逐行读取输入文件，并不解释反斜杠序列（-r标志）。
使用shell word splitting拆分该行，在本例中为空格。前三个字段分配给col个参数，其余部分分配到rest。
printf行基本上打印相同的行，但使用parameter expansion将第一个字段的值替换为第三个字段中的SEQUENCE。
结果如下：
45_342 2 45_342_2 A G
234_43 45 234_43_45 T G
12_45 9 12_45_9 C C
1233_456 134 1233_456_134 T A
如果你要计时，sed和awk解决方案，你很可能会发现sed比这更快，并且比sed更快。
答案 2 :(得分：0)
NodeList.prototype[Symbol.iterator] = Array.prototype[Symbol.iterator];