计算graphlet程度分布协议

时间:2016-04-30 14:47:32

标签: r graph-theory

我使用igraph库进行PPI网络分析。我的网络没有加权和无向。 Igraph提供了一个名为graphlets的函数,但它对加权网络进行建模。有一个名为ergm.graphlets的包,但我无法获得任何适当的文档,包含此包的示例。任何人都可以建议使用哪个包装..?或任何其他适合图基元计算的工具。我的示例脚本如下。

library(igraph)
g2 <- graph.formula(A:B - A:C, X:Z - X:Y - X:B, C:Z , C:X )
g2
plot(g2)

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