为什么Mysql 5.6在相同的代码库上运行速度比Mysql 5.5慢？

Question

我们刚搬到新服务器，都运行ubuntu 14.04LTS，唯一的区别基本上是老服务器运行mysql5.5，新的有mysql5.6。两台服务器都是由digitalocean托管的云计算机。两者都在默认的my.cnf设置下运行，没有太多调整过。

另一个重要的区别是，新服务器的RAM和CPU功率都是双倍的。

仍然 - 虽然老服务器以一个0.6秒的响应时间运行api呼叫，我们监视服务器健康状况，新的速度慢1.6-1.8。是的，它们包含大量连接，但这不是我的观点 - 代码库完全相同，机器本身应该更强大。新服务器每小时也会显示几次CPU使用率的峰值，这在mysql 5.5中从未发生过。

这有意义吗？对我来说，不是那么多，但我不是MySQL大师。

Ran MySQL Tuner，但不确定其中是否有任何相关内容：

• OLD服务器的mysqltuner输出： http://pastebin.com/cqSSssW0
• 新服务器的mysqltuner输出： http://pastebin.com/uk3g1KZa

my.cnf中唯一调整过的是它应该记录慢查询。

任何想法，为什么会发生这种情况？ MySQL5.6显然在我在网上看到的基准测试上运行得更快。非常感谢任何帮助。