使用自定义刻度的{GGplot自定义比例转换

时间:2016-07-12 15:49:13

标签: r ggplot2 axes

我正在尝试使用自定义缩放/轴转换,如下所示:

library(ggplot2)
library(scales)

dat <- data.frame(
  time.tot = c(407.17, 168.83, 127.8, 108.88, 69.04, 68.5, 59.76, 407.17, 
               168.83, 127.8, 108.88, 69.04, 68.5, 59.76, 407.17, 168.83, 127.8, 
               108.88, 69.04, 68.5, 59.76),
  error = c(0, 0.01, 0.05, 0.1, 0.5, 0.7, 1, 1.91e-06, 0.00229, 0.00884, 
            0.0172, 0.128, 0.128, 0.22, 1.43e-08, 0.000337, 0.00121, 0.00221, 
            0.0123, 0.0123, 0.0213, 0, 0.01, 0.05, 0.1, 0.5, 0.7, 1, 1.91e-06, 
            0.00229, 0.00884, 0.0172, 0.128, 0.128, 0.22, 1.43e-08, 0.000337, 
            0.00121, 0.00221, 0.0123, 0.0123, 0.0213),
  type = rep(c("A", "B", "C"), each=7))

eps <- 1e-8
tn <- trans_new("logpeps",
                function(x) log(x+eps),
                function(y) exp(y)-eps,
                domain=c(0, Inf),
                breaks=c(0, 0.1, 1))

ggplot(dat, aes(x=time.tot, y=error, color=type)) +
  geom_line() + geom_point() + coord_trans(y = tn)

enter image description here

如您所见,y轴确实由我指定的函数y=log(x+eps)转换。 breaks参数没有任何效果。我确定我说错了,但我无法从文档中找出如何使它工作。有什么建议吗?

我也想知道如何“修复”弯曲的线条 - 看起来它们是以原始比例绘制的,然后使用我的自定义tn进行转换。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您可能需要直接在y轴上设置比例:

ggplot(dat, aes(x=time.tot, y=error, color=type)) +
  geom_line() + geom_point() + coord_trans(y = tn)
  + scale_y_continuous(breaks = c(0,0.1,1))

此外,非直线是coord_trans的预期行为。来自帮助:“coord_trans与规模变换不同,因为它发生在统计变换之后,会影响geoms的视觉外观 - 不能保证直线会继续变直。”

相反,请尝试:

b <- 10^-c(Inf, 8:0)
ggplot(dat, aes(x=time.tot, y=error, color=type)) +
  geom_line() + geom_point() + scale_y_continuous(breaks = b, labels=b, trans = tn)

enter image description here

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