如何从git repo中仅拉出差异

Question

我有2个具有相同文件的Web服务器，但可能有4-5个文件有更改。具有更改的服务器已经绑定到bitbucket上的git repo。 如何将我的第二台服务器绑定到同一个git repo，只对具有差异的文件进行更改（所有其他文件相同[来自同一个webapp]）。

对于基本问题我很抱歉，我很难把头围绕着git，如何在不破坏任何一个系统的情况下做到这一点。