Question

我在将bash脚本变量传递到awk命令行时遇到了一些麻烦。

这是伪代码：

for FILE in $INPUT_DIR/*.txt; do
 filename=`echo $FILE | sed -n 's/^.*\(chr[0-9A-Z]*\).*.vcf$/\1/p'`
 OUTPUT_FILE=$OUTPUT_DIR/$filename.snps.txt
 egrep -v "^#" $FILE | awk '{print $2,$4,$5}' > $OUTPUT_FILE
done

我想要列的最后一行，我希望它是灵活的或用户输入。例如，用户可能还需要列6,7和8，或者列133和138，或者列245到248.因此，我如何自定义这样我可以将'print $ 2 .... $ 5'设置为用户输入的东西？例如，用户将运行此脚本，如：bash script.sh input_dir output_dir [用户输入任何列的列]，然后我将在输出中获取这些列。我尝试传入它，但我想我没有正确的语法。

Answer 1

使用awk，你应该在使用之前声明变量。这比escape方法更好（awk'{print $'$ var'}'）：

awk -v var1="$col1" -v var2="$col2" 'BEGIN {print var1,var2 }'

其中$ col1和$ col2将是输入变量。也许你可以尝试输入变量作为字符串“$ 2，$ 4，$ 5”并打印此变量以获取值（我不确定这是否有效）

Answer 2

以下测试对我有用：

A="\$3" ; ls -l | awk "{ print $A }"

如何将变量传递给awk命令行

2 个答案: