Question

我正在尝试使用scipy

读取matlab文件

import scipy.io as sio

data = sio.loadmat(filepath)

但我收到了错误

ValueError: Did not fully consume compressed contents of an miCOMPRESSED element. This can indicate that the .mat file is corrupted.

在Matlab中我可以毫无问题地打开这个文件。我还试图再次保存它，但没有改变...... 你能救我吗？

此处：https://drive.google.com/drive/folders/0B3vXKJ_zYaCJanZfOUVIcGJyR0E 你可以找到以同样方式保存的2个文件..

我可以打开part_000，但不能打开part_001 ....为什么？：（

Answer 1

这个问题似乎是由压缩造成的。 {7}文件将从版本7开始自动压缩。

因此，我建议尝试将文件保存在较早的未压缩.mat文件版本6中：

.mat

Answer 2

我可以使用Octave加载这两个文件，并重写导致问题的文件

>> data1 = load('part_0001.mat');
>> save -v7 part_0002.mat -struct data1

在Python中，重写的文件加载正常，就像您的0000.mat文件一样。

In [8]: data2=loadmat('part_0002.mat')
In [10]: data2.keys()
Out[10]: dict_keys(['RealTime', 'AccNorm', 'Alt', 'FsP', 'DeviceTime', 'FsA', 'Acc', 'imatemp', 'Time', '__version__', '__globals__', '__header__'])

重写的文件实际上要小一些。 V6文件为13M，也可以加载。

>> save -v6 part_0003.mat -struct data1

因此loadmat's处理V7格式时必定存在一些问题。

Answer 3

有时mat文件损坏，因此Matlab无法识别数据类型并且无法加载它。因此在保存Mat文件时。尝试通过设置long_field_names = True

保存Mat文件

scipy.io.savemat（filename，long_field_names = True）

Answer 4

问题出在scipy.io.loadmat的{{1}}关键字参数上，默认为verify_compressed_data_integrity。它试图对标头进行一些错误检查，但即使提取的数据很好，也可能引发错误。参见this related GitHub issue。我不确定全职关闭此功能的含义，但是如果您使用以下功能，它可以同时解决您的问题（我无法根据您的数据进行检查，它在提供的URL上不再可用）

True

无法用scipy读取MAT文件

4 个答案: