从域ncfile中提取数据

时间:2017-04-23 23:00:52

标签: python coordinates netcdf nco

我正在尝试从由lat / lon边界定义的用户指定(非矩形)域中的每个网格单元格中提取数据。我的输入文件位于曲线网格上。我已经尝试了各种方法python,cdo,ncks,但我仍然无法弄明白。我只想在输入ncfile的多边形域子集中为每个网格单元格提供一系列信息。我的输入ncfile信息在这里给出:

$ ncdump -h 1979_sfc_out.nc 

netcdf \1979_sfc_out {
dimensions:
    x = 83 ;
    y = 94 ;
    time = UNLIMITED ; // (8736 currently)
    nv4 = 4 ;
variables:
    float time(time) ;
        time:axis = "T" ;
        time:long_name = "time" ;
        time:standard_name = "time" ;
        time:units = "hours since 1979-1-2 00:00:00" ;
        time:calendar = "standard" ;
    float x(x) ;
        x:axis = "x" ;
        x:long_name = "X-coordinate in Cartesian system" ;
        x:standard_name = "projection_x_coordinate" ;
        x:units = "meters" ;
    float y(y) ;
        y:axis = "y" ;
        y:long_name = "Y-coordinate in Cartesian system" ;
        y:standard_name = "projection_y_coordinate" ;
        y:units = "meters" ;
    float lon(y, x) ;
        lon:units = "degrees_east" ;
        lon:valid_range = -180., 180. ;
        lon:standard_name = "longitude" ;
        lon:bounds = "lon_bnds" ;
    float lat(y, x) ;
        lat:units = "degrees_north" ;
        lat:valid_range = -90., 90. ;
        lat:standard_name = "latitude" ;
        lat:bounds = "lat_bnds" ;
    float lon_bnds(y, x, nv4) ;
        lon_bnds:units = "degreesE" ;
    float lat_bnds(y, x, nv4) ;
        lat_bnds:units = "degreesN" ;
    char mapping ;
        mapping:false_easting = 0. ;
        mapping:false_northing = 0. ;
        mapping:grid_mapping_name = "polar_stereographic" ;
        mapping:latitude_of_projection_origin = 90. ;
        mapping:standard_parallel = 64. ;
        mapping:straight_vertical_longitude_from_pole = -152. ;
        mapping:semi_major_axis = 6370000. ;
        mapping:semi_minor_axis = 6370000. ;
    float SEAICE(time, y, x) ;
        SEAICE:_FillValue = -9999.f ;
        SEAICE:units = "fraction" ;
        SEAICE:long_name = "Ice concentration (ice=1;no ice=0)" ;
        SEAICE:grid_mapping = "mapping" ;
        SEAICE:coordinates = "lon lat" ;

我尝试过的一些事情是

lat1=71.2
lat2=72.9
lon1=-176.5
lon2=-160

cdo sellonlatbox,lon1,lon2,lat1,lat2 $ifile $box1_ofile
cdo sellonlatbox (Abort): Float parameter >lon1< contains invalid character at position 1!

我认为问题是我的输入文件有x,y维度(以米为单位(没有负号,可能是位置1&#39;的无效字符),我问的是cdo以度为单位提取纬度/经度。我有变量&#39;映射&#39;在我的ncfile中,将米转换为lat / lon可能很有用,但我无法弄清楚如何做到这一点。

ncks在这里对我不起作用,可能是由于相同的仪表&lt; - &gt; lon / lat问题我用cdo看到了。

ncks -v SEAICE,U10,V10 -d latitude,71.2,72.9 -d longitude,-176.5,-160. $ifile -O $box1_ofile

ncks: ERROR dimension latitude is not in input file

虽然我想要一个多边形提取,但我尝试过的这些例子只是矩形子集,我认为它可以得到多边形我可以做多个矩形子集来实现我的最终多边形形状,但如果有更好的方法来做到这一点任何建议表示赞赏。

由于

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

NCO的辅助坐标feature设计用于具有1-D lat和lon的非结构化网格上的hyperslab曲线坐标。试试这个:

ncks -X lon_min,lon_max,lat_min,lat_max in.nc out.nc
ncks -X -176.5,-160.,71.2,72.9 in.nc out.nc

您也可以菊花链式连接多个-X选项以获得奇怪的多边形。不幸的是,这可能不会对你有用,因为我注意到,你有一个2D lat和lon的曲线网格。为此,尝试使用feature的ncap2。手册中的示例显示了如何沿矩形边界进行屏蔽,您可以菊花链式连接where()语句中的条件以获取多边形。这不会更改输出文件的维度,但它允许您将多边形外部的所有内容设置为_FillValue。

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