Question

我有以下目录结构

my_func
    - my_func_r.cpp
    - my_func.c
    - my_func.h
    - my_func_test.c
    - matrix/
      - matrix.h
      - matrix.c

matrix目录包含matrix.h中的一些矩阵结构以及matrix.c中的一些初始化，免费，打印等功能。 my_func.h文件类似于

#include <math.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include "matrix/matrix.h"

... some structures and templates ...

my_func.c文件是

#include "my_func.h"

... helper functions ...

int my_func(...) {
    ... my_func stuff ...     
    return 0;
}

my_func_test.c就像是

#include "my_func.h"

int main() {
    ... some test ...
    return 0;
}

使用gcc/g++我可以使用

运行

gcc my_func_test.c my_func.c matrix/matrix.c -o test -lm

最终文件my_func_r.cpp是Rcpp结构与my_func.c中使用的结构之间的接口。它目前就像是

#include "my_func.h"
#include <Rcpp.h>

// [[Rcpp::export]]
int my_func_r(Rcpp::List x, ...) {
    ... convert inputs to structure recognised by my_func.h ...       
    ... run my_func.c ...
    ... put returned objects back into one of the R structure ...

    return 0;
}

我遇到的问题是如果我现在运行

sourceCpp('my_func_r.cpp', verbose=TRUE, rebuild=TRUE)

它抱怨matrix/matrix.c中的函数缺少符号。解决方法是简单地粘贴my_func顶部的matrix和my_func_r.cpp文件中的所有标头和源代码。

然而，这对于代码维护来说是一种非常不令人满意的解决方案。完成我想做的最简单的方法是什么？

Answer 1

快速的：

这对Rcpp 本身
您只是在R build中使用更高级/更复杂的src/目录。
在写R扩展中有关于此的官方文档，之前已经提出了问题。
您可以首先在子目录中编译libmatrix.a并链接到该目录。这可以通过简单的src/Makevars来实现，但仍然不鼓励。请继续阅读。
但这是一个自伤的伤口。只需将matrix.h和matrix.c复制到src/，调整包含路径，即可完成。
一如既往：创建一个包。不要在较大的设置上使用sourceCpp()。它是不，

在Rcpp中编译多个源文件

1 个答案: