Question

如何将.csv文件中的第二列名称替换为目录中所有文件的相应文件名？有谁知道如何使用shell脚本执行此操作？ sed或awk

输入文件名CDXV1.csv

Gene,RPKM(26558640 pairs)
ENSTGUG00000013338 (GAPDH),971.678203888
ENSTGUG00000005054 (CAMKV),687.81249397
ENSTGUG00000006651 (ARPP19),634.296191033
ENSTGUG00000002582 (ITM2A),613.756010638

输出文件名CDXV1.csv（相同）

Gene,CDXV1(26558640 pairs)
ENSTGUG00000013338 (GAPDH),971.678203888
ENSTGUG00000005054 (CAMKV),687.81249397
ENSTGUG00000006651 (ARPP19),634.296191033
ENSTGUG00000002582 (ITM2A),613.756010638

Answer 1

awk -F, -v OFS=,  'NR==1{split(FILENAME,a,".");split($2,b,"(");$2= a[1] "(" b[2]}1' CDXV1.csv
Gene,CDXV1(26558640 pairs)
ENSTGUG00000013338 (GAPDH),971.678203888
ENSTGUG00000005054 (CAMKV),687.81249397
ENSTGUG00000006651 (ARPP19),634.296191033
ENSTGUG00000002582 (ITM2A),613.756010638

如果您的awk支持就地替换，请使用-i inplace：

awk -i inplace -F, -v OFS=,  'NR==1{split(FILENAME,a,".");split($2,b,"(");$2= a[1] "(" b[2]}1' *.csv

Answer 2

sed 解决方案：

for f in yourdir/*.csv; do sed -i "1s~^\([^,]*\),\([^(]*\)~\1,${f%%.*}~g" "$f"; done

详细：

for f in yourdir/*.csv - 遍历 csv 文件名
-i - 就地修改文件
1s - 仅在第一行执行替换
~ - 用作 sed 子命令部分分隔符
^$[^,]*$,$[^(]*$ - 捕获第一个字段和第二个字段值（直到遇到(）
${f%%.*} - bash变量替换，截断第一个.的右侧

用文件名shell脚本替换列名

2 个答案: