如果相邻行匹配,则用另一个数据帧中的行替换一个数据框中的列名

时间:2017-06-25 03:19:55

标签: r bioinformatics biomart

如果该数据帧中的相邻行匹配,我试图用另一个数据帧中的值替换一个数据帧的列名。

head(df1)

ensembl_gene_id     mgi_symbol
ENSMUSG00000021252  0610007P14Rik
ENSMUSG00000007777  0610009B22Rik
ENSMUSG00000086714  0610009E02Rik
ENSMUSG00000024442  0610009O20Rik
ENSMUSG00000042208  0610010F05Rik
ENSMUSG00000058706  0610030E20Rik

head(df2)

0610007N19Rik   0610007P14Rik   0610009B22Rik   0610009D07Rik   0610009E02Rik   0610009O20Rik   0610010F05Rik   0610011F06Rik   0610030E20Rik   0610031J06Rik   ⋯   mt-Tl1  mt-Tm   mt-Tp   mt-Tq   mt-Ts2  mt-Tv   3110079O15Rik   4933408B17Rik   Efcab9  Il17rd
GTCATCTTTACT.AJP1   -0.07497236 -0.1947123  -0.1656026  -0.252564   -0.08834634 5.2688983   -0.09093407 -0.1779879  -0.15511    1.6949233   ⋯   -0.02246199 -0.04942127 -0.09752107 -0.03143053 -0.03057371 -0.05273995 -0.02246199 -0.03175767 -0.02246199 -0.0824498
CCGACGTATCGT.AJP1   -0.07497236 -0.1947123  -0.1656026  -0.252564   -0.08834634 -0.1534577  -0.09093407 2.9506885   -0.15511    -0.2636754  ⋯   -0.02246199 -0.04942127 -0.09752107 -0.03143053 -0.03057371 -0.05273995 -0.02246199 -0.03175767 -0.02246199 -0.0824498
TTGGTACTTCCG.AJP1   -0.07497236 -0.1947123  -0.1656026  -0.252564   -0.08834634 -0.1534577  -0.09093407 -0.1779879  -0.15511    -0.2636754  ⋯   -0.02246199 -0.04942127 -0.09752107 -0.03143053 -0.03057371 -0.05273995 -0.02246199 -0.03175767 -0.02246199 -0.0824498
AAGAGCGCGTGC.AJP1   -0.07497236 -0.1947123  -0.1656026  -0.252564   -0.08834634 -0.1534577  -0.09093407 -0.1779879  -0.15511    -0.2636754  ⋯   -0.02246199 -0.04942127 -0.09752107 -0.03143053 -0.03057371 -0.05273995 -0.02246199 -0.03175767 -0.02246199 -0.0824498
GCTATCTTCCTN.AJP1   -0.07497236 -0.1947123  -0.1656026  -0.252564   -0.08834634 -0.1534577  -0.09093407 -0.1779879  -0.15511    -0.2636754  ⋯   -0.02246199 -0.04942127 -0.09752107 -0.03143053 -0.03057371 -0.05273995 -0.02246199 -0.03175767 -0.02246199 -0.0824498

在上面提供的示例中,我想将df2中的列名替换为df1$ensembl_gene_id中的匹配值。

nrow(df1)大于ncol(df2)并且存在不匹配的值,因此我不能简单地将colnames(df1)替换为df1$ensembl_gene_id

这可能是一个相对简单的数据争论问题,但我似乎无法弄明白。任何帮助将不胜感激。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我希望此代码可以帮助您:

ind <- match(names(df2), df1$mgi_symbol)
names(df2) <- df1$ensembl_gene_id[ind]
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