Question

我有一些数据以及这些数据点的成对距离矩阵。我想使用Agglomerative clustering对它们进行聚类。我在sklearn中读到，我们可以预先计算出＆＃39;作为亲和力，我希望它是距离矩阵。但我找不到任何使用预计算亲和力和自定义距离矩阵的示例。任何帮助将不胜感激。

Answer 1

让我们调用您的距离矩阵D。

agg = AgglomerativeClustering(n_clusters=5, affinity='precomputed')
agg.fit_predict(D)  # Returns class labels.

如果您对生成整个层次结构并生成树形图感兴趣，scikit-learn的API将包裹scipy hierarchical clustering code。只需直接使用scipy代码。