使用AWK从制表符分隔文件中提取一列

Question

我知道这是一个简单的问题，但awk命令实际上正在融化我的大脑。我有一个制表符分隔文件＆＃34; inputfile.gtf＆＃34;我需要从中提取一列并将其放入一个新文件＆＃34; newfile.tsv＆＃34;我不能为我的生活找出使用awk执行此操作的正确语法。这是我尝试过的：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}'  inputfile.gtf  > newfile.tsv

也

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

这两个都只给我一个空文件。在我搜索的每个地方，人们似乎都有完全不同的方式来尝试完成这个简单的任务，而在这一点上我完全迷失了。任何帮助将不胜感激。感谢。

Answer 1

您指定了错误的分隔符/t，标签字符键入为\t：

awk 'BEGIN{ FS=OFS="\t" }{ print $8 }' inputfile.gtf  > newfile.tsv

Answer 2

为什么不简单：

awk -F'\t' '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

Answer 3

您的第一命令：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}'  inputfile.gtf  > newfile.tsv

您设置的-F,不是必需的，因为您的文件不是以,逗号分隔的。

接下来，OFS="/t"：语法不正确，它应该是OFS="\t"，但您不需要这样做，因为您不希望将输出字段分隔符设置为{{ 1}}因为你只打印一个记录而OFS根本不涉及这种情况;除非你打印至少两个字段。

您的第二命令：

\t

同样不是awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 它应该是/t。此外，\t与FS="\t"

类似

您实际需要的是：

-F "\t"

或

awk -F"\t" '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

如果您的文件只有awk -v FS="\t" '{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 并且您的字段之间没有空格，那么您只需使用：

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