在多个文件上运行脚本

Question

我想对一批文件执行script，所有文件都有.xml扩展名。

受以前帖子的启发，我尝试了以下内容：

for file in *.xml; do ./script.sh <"$file"; done

和

for i in $(\ls -d *.xml)
do
    ./script.sh -i /path/*.xml -d /output_folder $i
done

这两个脚本多次运行脚本，但只运行该文件夹中的第一个.xml文件。所以我最终得到了十几个输出文件，但它们都是file1.txt，file1.txt_1，file1.txt_2等。循环随机停止，有时在3次迭代后停止，有时在28次之后停止。

任何帮助将不胜感激， 谢谢， TP

Answer 1

for f in /input_path/*.xml; do
  ./interproscan.sh -mode convert -f raw -i "$f" -d /output_path
done

Answer 2

更简单安全的方法是：

while IFS=  read -r -d $'\0'; do
    ./interproscan.sh -mode convert -f raw -i "$REPLY" -d /output_path
done < <(find . -iname "*.xml" -print0)

注意

1）使用iname搜索不区分大小写。

2）“$ variable”可以帮助你，如果文件名有一些空间。

Answer 3

您可以使用find -exec选项，而不是循环使用文件。它将对每个文件执行命令，将{}替换为文件的路径。请注意，您必须使用转义分号（\;）结束命令。

这样的事可能适合你：

find . -name "*.xml" -exec ./script.sh -i /path/*.xml -d /output_folder {} \;

但是你只能插入{}一次，交替使用你可以做到这一点的循环：

xmlFiles=( $(find . -name "*.xml") )
for i in ${xmlFiles[@]}
do
   ./script.sh -i /path/*.xml -d /output_folder $i
done