使用多个处理器来运行shell脚本

Question

壳牌：

for a in `ls -1 *.pdb`; do ./fud --pdb=$a --command=run --state=-CRYSTAL --element=ion ; done 

cat //home/*.fxout  >> results.out

fgrep -v 1 results.out > new.out

Answer 1

考虑使用 GNU Parallel ，如下所示：

parallel ./fud —pdb={} —command=run —state=-CRYSTAL —element=ion ::: *.pdb

有一个很棒的教程here。

Answer 2

尝试xargs（-P指定要运行的并行进程数）：

ls -1 *.pdb | xargs -I {} -P8 ./fud --pdb={} --rest-of-switches > result.out