步骤1

Question

我开发了一个闪亮的应用程序，允许用户通过R Markdown下载HTML报告。我正在尝试将自定义CSS和图像包含到我的rmarkdown文件中。但是，我不断收到此错误消息：

pandoc: Could not fetch (either css or image file)
openBinaryFile: does not exist (No such file or directory)

当我在R Studio上编织.rmd文件时，它能够引用我想要的图像文件或css。但是，当我运行Shiny应用程序并下载html文件时，我收到上述错误消息。我甚至试图将图像和css文件放在与.rmd文件相同的工作目录中，但无济于事......

output:
  html_document:
   css: pandoc.css

(same error message as above)

一直试图为此找到一个解决方案但似乎无法帮助......

Answer 1

我有类似的问题。我没有使用完整的文件路径。我正在使用〜/ path / to / file。我将其更改为完整路径（即删除了〜/），并且可以正常工作。

Answer 2

我也遇到了这个问题，但是对我来说，原因是RStudio项目位于共享驱动器上，并且已经通过网络位置将其打开。当我关闭项目，并通过映射的网络驱动器将其打开时，该问题已解决。（如果您运行getwd()时您的位置以\\开头，则可能是您正在发生的情况。）

Answer 3

我与RStudio和pandoc错误（openBinaryFile错误）有关的问题是由于创建和加载项目的文件路径所致。

Project File Path

创建项目时，我使用通用路径创建了该路径，这是上图中的第二个选项。但是，当我将其更改为映射的驱动器号时，上面的选项却消失了，我的pandoc错误消失了。

我正在运行RStudio 1.2.1335和R版本3.4.4

Answer 4

我一直遇到类似的问题，在带有网络文件存储的Windows计算机上使用RStudio，rmarkdown和pandoc。我听了各种建议，将驱动器映射到一个字母，但仍然没有帮助。

最终，我发现libPaths中的路径之一包含网络位置/通用路径。我将该libpath更新为映射的字母驱动器，并且一切似乎都进行得很好！希望这可能对某人有所帮助。

Answer 5

我认为我有同样的问题。我最初尝试过Changing the Default Directory，但是每次我去编织RMarkdown文件时，都会出现相同的错误集，表明该过程仍在尝试访问Network H驱动器而不是本地C驱动器上的文件，特别是它正在网络驱动器上的rmarkdown库文件中查找。我以为我遵循了上面的建议，但是在那之后不起作用了，我尝试删除网络驱动器中的rmarkdown文件夹

例如：\\fwnew12\Home\My Documents\R\win-library\3.6\rmarkdown。

这似乎迫使R仅使用我的本地C驱动器（C:/Program Files/R/R-3.6.3/library）并最终成功编织了PDF。也许这不是推荐的方法，但是我只需要一些可行的方法。

Answer 6

我最近在Windows工作计算机上遇到了这个问题，我只是在.libPaths()文件中设置了Rprofile.site。这与以前的答案一致，但更详细。

步骤1

检查您当前的路径：

> .libPaths()
[1] "\\\\my_work_server.se/some_subdir$/username/Dokument/R/win-library/3.6"
[2] "C:/R/R-3.6.3/library"

第2步

查找\\\，在本例中为路径"\\\\my_work_server.se/some_subdir$/username/Dokument/R/win-library/3.6"。该路径很可能是某些已经挂载的主目录，在我的情况下是H: = "\\\\my_work_server.se/some_subdir$/username/。如果您没有挂载的目录，则可能要先修复此目录或将库路径更改为另一个目录。

步骤3

因此，如果您在C:/R/R-3.6.3/下安装了R，则可以编辑文件C:/R/R-3.6.3/etc/Rprofile.site并添加：

.First <- function(){
  .libPaths(c("H:/Dokument/R/win-library/3.6", "C:/R/R-3.6.3/library"))
}

请记住将H:更改为安装网络目录的位置。

步骤4

就这样，重新启动R，您应该就能编织文档。

Answer 7

我也收到类似的错误消息，但就我而言，问题是我在其中一个块标题中使用了class CsvEditor(Widget): def on_keyboard(self, window, key, scancode, codepoint, modifier): if modifier == ['ctrl'] and codepoint == '+': class CsvEditorKivy(App): def build(self): editor = CsvEditor() Window.bind(on_keyboard=editor.on_keyboard) self.title = 'CSV Editor' return editor符号：

{% if inputs.parameters.resources.gpu == 1 %}
    nvidia.com/gpu: {{ inputs.parameters.resources.gpu }}
{% end %}

如果仅在Rstudio中运行笔记本就没有问题，但是显然使knitr / pandoc混淆了：编织时，我收到一条错误消息，如

从块标题中删除```{r show distribution of # of commits per month}解决了这个问题。

Answer 8

我在运行时遇到了同样的消息：

pandoc -s foo.html foo.md

我完全错过了应该出现的 -o 标志

pandoc -s -o foo.html foo.md

对于后者，一切都像魅力一样。

R Markdown：openBinaryFile：不存在（没有这样的文件或目录）

8 个答案:

步骤1

第2步

步骤3

步骤4