R:按时间间隔划分观察值并将其汇总到时间间隔

时间:2018-01-09 14:32:49

标签: r time intervals

在某些区域(名称),各种观察点( obs )都会观察到鸟类。 开始结束时间已经过去,并且时间差( diff_corr )会使用修正系数重新计算,因此它不仅仅是{{1开始结束间隔。

我现在需要"拆分"这些价值观对于#34;不错"间隔(15分钟,例如10:15:00,10:30:00,......)然后按区域聚合(名称)以便能够制作出现的情节这些地区的鸟类只需15分钟的间隔。

所以,为了让它更清晰一点:观察可能会在10:14开始直到10:25,所以它跨越10:00-10:15和10:15-10:30的间隔,所以我得到的价值应该被拆分,并按照它们进入该区间的部分相应地分配给它。

在更复杂的设置中,观察可能跨越3或4个间隔,因此值也必须相应地分开。

最后一步是每个区间聚集所有观察部分并绘制它们。

我已经搜索了几天的解决方案,但只发现了非常简单的示例,其中间隔是使用difftimecut重新排列的,但从不说明如何处理相关值,而是简单的频率计数。

示例数据:

breaks

P.S。我很难正确地指出我的问题,所以任何提示(不仅仅是那个)都受到高度赞赏

一个小例子的新尝试: 按比例将值分配给间隔(稍后总计相等的间隔)

structure(list(obs = structure(c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = c("b", 
"C2", "Dürnberg2"), class = "factor"), name = c("C2", "C2", 
"C2", "C2", "C2", "C2", "C2", "C2", "C2", "b", "981", "1627", 
"b", "b", "981", "1627", "b", "b", "b", "b"), start = structure(c(1495441500, 
1495441590, 1495441650, 1495441680, 1495447380, 1495447410, 1495447530, 
1495447560, 1495447580, 1496996580, 1496996580, 1496996580, 1496996760, 
1496996820, 1496996820, 1496996820, 1496997180, 1496997300, 1496997420, 
1496998260), class = c("POSIXct", "POSIXt"), tzone = ""), end = structure(c(1495441590, 
1495441650, 1495441680, 1495441800, 1495447410, 1495447530, 1495447560, 
1495447580, 1495447620, 1496996760, 1496996760, 1496996760, 1496996820, 
1496997180, 1496997180, 1496997180, 1496997300, 1496997420, 1496997540, 
1496998320), class = c("POSIXct", "POSIXt"), tzone = ""), diff_corr = c(1.46739130434783, 
0.978260869565217, 0.489130434782609, 1.95652173913043, 0.489130434782609, 
1.95652173913043, 0.489130434782609, 0.326086956521739, 0.652173913043478, 
2.96703296703297, 2.96703296703297, 2.96703296703297, 0.989010989010989, 
5.93406593406593, 5.93406593406593, 5.93406593406593, 1.97802197802198, 
1.97802197802198, 1.97802197802198, 0.989010989010989)), .Names = c("obs", 
"name", "start", "end", "diff_corr"), row.names = c("1", "9", 
"7", "8", "3", "2", "4", "5", "6", "13", "13.1", "13.2", "22", 
"11", "11.1", "11.2", "12", "23", "15", "16"), class = "data.frame")

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这很慢而且很笨重,但也许它很有帮助。按名称和15分钟间隔计算计数和加权diff_corr总和:

library(dplyr)
range <- seq.POSIXt(min(df$start)-(15*60), max(df$end)+(15*60), by = "15 min")

df$totalDuration <- as.numeric(as.difftime(df$end-df$start),units=c("secs"))

out <- NULL
for (r in 1:length(range)){
  subset <- df %>% filter( (start >= (range[r]-(15*60)) & start<range[r]) |
                             (end>= (range[r]-(15*60)) & end<range[r] ) |
                             (end > range[r] & start < range[r])) %>%
    mutate(bin=range[r],
           duration = ifelse(start>=(range[r]-(15*60)) & end<range[r],totalDuration,
                        ifelse(start>=(range[r]-(15*60)),as.numeric(as.difftime(range[r]-start),units="secs"),
                          ifelse(end<range[r],
                                 as.numeric(as.difftime(end-(range[r]-(15*60))),units="secs"),
                                            as.numeric(as.difftime(range[r]-(range[r]-(15*60))),units="secs")
                        )))
           ) %>% 
    mutate (diff_corr_W = diff_corr*(duration/as.double(totalDuration, units='secs'))) %>%
    group_by(bin,name) %>% summarise(count=n(),
                                     diff_corr_sum = sum(diff_corr_W)) %>% ungroup()


  if (is.null(out)){
    out <- subset
  } else {
    out <- rbind(out,subset)
  }
}


> out
# A tibble: 9 x 4
bin  name count diff_corr_sum
*              <dttm> <chr> <int>         <dbl>
  1 2017-05-22 04:40:00    C2     4      4.891304
2 2017-05-22 06:10:00    C2     5      3.913043
3 2017-06-09 04:25:00  1627     1      1.978022
4 2017-06-09 04:25:00   981     1      1.978022
5 2017-06-09 04:25:00     b     1      1.978022
6 2017-06-09 04:40:00  1627     2      6.923077
7 2017-06-09 04:40:00   981     2      6.923077
8 2017-06-09 04:40:00     b     6     13.846154
9 2017-06-09 04:55:00     b     1      0.989011

答案 1 :(得分:1)

这是一种Intent mainIntent = getActivity().getIntent(); mainIntent.putExtra(Constants.TICKET_DONT_SHOW_QRCODE_SCREEN, true); getActivity().setIntent(mainIntent); 方法,允许您使用SQL类型查询对数据进行排序/过滤并执行操作。

数据

data.table

<强> CODE

> p
    obs name               start                 end diff_corr
 1:  C2   C2 2017-05-22 04:25:00 2017-05-22 04:26:30 1.4673913
 2:  C2   C2 2017-05-22 04:26:30 2017-05-22 04:27:30 0.9782609
 3:  C2   C2 2017-05-22 04:27:30 2017-05-22 04:28:00 0.4891304
 4:  C2   C2 2017-05-22 04:28:00 2017-05-22 04:30:00 1.9565217
 5:  C2   C2 2017-05-22 06:03:00 2017-05-22 06:03:30 0.4891304
 6:  C2   C2 2017-05-22 06:03:30 2017-05-22 06:05:30 1.9565217
 7:  C2   C2 2017-05-22 06:05:30 2017-05-22 06:06:00 0.4891304
 8:  C2   C2 2017-05-22 06:06:00 2017-05-22 06:06:20 0.3260870
 9:  C2   C2 2017-05-22 06:06:20 2017-05-22 06:07:00 0.6521739
10:   b    b 2017-06-09 04:23:00 2017-06-09 04:26:00 2.9670330
11:   b  981 2017-06-09 04:23:00 2017-06-09 04:26:00 2.9670330
12:   b 1627 2017-06-09 04:23:00 2017-06-09 04:26:00 2.9670330
13:   b    b 2017-06-09 04:26:00 2017-06-09 04:27:00 0.9890110
14:   b    b 2017-06-09 04:27:00 2017-06-09 04:33:00 5.9340659
15:   b  981 2017-06-09 04:27:00 2017-06-09 04:33:00 5.9340659
16:   b 1627 2017-06-09 04:27:00 2017-06-09 04:33:00 5.9340659
17:   b    b 2017-06-09 04:33:00 2017-06-09 04:35:00 1.9780220
18:   b    b 2017-06-09 04:35:00 2017-06-09 04:37:00 1.9780220
19:   b    b 2017-06-09 04:37:00 2017-06-09 04:39:00 1.9780220
20:   b    b 2017-06-09 04:51:00 2017-06-09 04:52:00 0.9890110

<强>输出

library(data.table)
library(lubridate)
p <- as.data.table(p)
p[, .(new_diff = mean(diff_corr)), .(tme_start = round_date(start, unit = "15min"))]

Data.Table在做什么?

由于您不熟悉> p[, .(new_diff = mean(diff_corr)), .(tme_start = round_date(start, unit = "15min"))] tme_start new_diff 1: 2017-05-22 04:30:00 1.2228261 2: 2017-05-22 06:00:00 0.7826087 3: 2017-06-09 04:30:00 3.3626374 4: 2017-06-09 04:45:00 0.9890110 ,这里有一个非常快速,基本的描述正在发生的事情。 data.table来电的一般形式是:

data.table

其中DT[select rows, perform operations, group by] DT名称。 data.table是一个逻辑操作,例如假设您只想观察C2(名称),则调用将是Select rows无需执行任何操作且无需分组。如果您希望所有DT[name == "C2",]的{​​{1}}列总和,则呼叫将变为diff_corr。您可以使用name == "C2"而不是撰写DT[name == "C2", list(sum(diff_corr))]。输出现在只有一行和一列list(),它是.()时所有V1的总和。该列没有很多信息,因此我们为其指定一个名称(可以与旧名称相同):diff_corr。假设你有另一个名为“情绪”的专栏,它报告了观察者的情绪并且可以假设三个值(“快乐”,“悲伤”,“困”)。你可以“分组”心情:name == "C2"。输出将是对应于每个情绪的三行和一列DT[name == "C2", .(diff_corr_sum = sum(diff_corr))]。要更好地理解这一点,请尝试使用像DT[name == "C2", .(diff_corr_new = sum(diff_corr)), by = .(mood)]这样的示例数据集。您的示例数据没有足够的复杂性等,以便您可以探索所有这些功能。

回到答案 - 其他变体

如果您想根据diff_corr_newmtcars进行舍入,则问题或评论中不清楚。我使用前者,但你可以改变它。上面的示例使用start,但您可以执行您可能需要的任何其他操作。其他列似乎或多或少是多余的,因为它们是字符串,你不能用它们做太多。您可以使用它们对end条目(代码中的最后一个字段)中的结果进行进一步排序。以下是分别使用meanby的两个示例。您也可以将所有这些组合在一起。

obs