我目前在R中有一个数据集，对于每个基因，我有四个暴露于铜的水蚤的log2表达（第2列：第5列）和四个对照水蚤（第6：9列）。数据框的头部如下所示：
GENE_ID s_MC13_A9_Cu s_MC13_A10_Cu s_MC13_A11_Cu s_MC13_A12_Cu
1 GENE:JGI_V11_100009 3.202503 3.152049 3.171360 3.164072
2 GENE:JGI_V11_100036 3.241468 3.226221 3.217426 3.208969
3 GENE:JGI_V11_100044 3.220307 3.223803 3.171068 3.228047
4 GENE:JGI_V11_100045 3.030001 3.017256 3.028523 3.013106
5 GENE:JGI_V11_100062 3.487595 3.471572 3.517525 3.503789
6 GENE:JGI_V11_100066 3.576387 3.671755 3.589585 3.573903
s_MC13_C1_C s_MC13_C2_C s_MC13_C3_C s_MC13_C4_C
1 3.154395 3.174957 3.153786 3.188665
2 3.201010 3.211897 3.201822 3.220532
3 3.201586 3.183351 3.178189 3.178734
4 3.021061 3.023119 3.068359 3.053681
5 3.525903 3.532097 3.532113 3.530310
6 3.624656 3.534701 3.697618 3.513394
我希望能够创建一个描绘差异表达的火山图，因此首先需要为我的每个基因产生P值。我想过做一个t检验或Ebayes这样做，这是微阵列数据的最佳选择吗？如果是这样，我该如何进行，从而为第一列中的每个基因生成P值？
谢谢