Bonferroni同时置信区间差异的间隔

Question

我试图在R中获得Bonferroni同时置信区间。我有以下数据集，我为实践做了准备：

df2 <- read.table(textConnection(
  'group value
  1 25 
  2 36
  3 42
  4 50
  1 27
  2 35
  3 49
  4 57
  1 22
  2 37
  3 45
  4 51'), header = TRUE)

我试过了

aov(formula = value ~ group, data = df2)

但是，这并不会同时输出置信区间。使用SAS，计算应该如下：

Answer 1

似乎存在一些概念/编码错误。

1. df$group需要是您的ANOVA工作的分类变量。目前它是数字。
2. 您想要执行所谓的post-hoc analysis，以更正多组比较的ANOVA p值。

以下是使用R包DescTools的示例，基于您提供的示例数据：

# Step 1: Make sure that group is a factor
df2$group <- as.factor(df2$group);

# Step 2: Perform ANOVA
res <- aov(formula = value ~ group, data = df2)

# Step 3: Perform post-hoc analysis
require(DescTools);
PostHocTest(res, method = "bonferroni");
#
#  Posthoc multiple comparisons of means : Bonferroni
#    95% family-wise confidence level
#
#$group
#         diff     lwr.ci   upr.ci    pval
#2-1 11.333333  3.0519444 19.61472 0.00855 **
#3-1 20.666667 12.3852778 28.94806 0.00014 ***
#4-1 28.000000 19.7186111 36.28139 1.5e-05 ***
#3-2  9.333333  1.0519444 17.61472 0.02648 *
#4-2 16.666667  8.3852778 24.94806 0.00067 ***
#4-3  7.333333 -0.9480556 15.61472 0.09062 .
#
#---
#Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

报告的组均值和置信区间之间的差异与您给出的SAS数字相符。