将行名转换为数字

Question

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我习惯了这个

mydata3 <- data.frame(sapply(mydata2, as.integer))

但是现在我看到作为基因名称的行名称已被转换为1-200之类的数字。但是我应该指出我之前使用过的相同的命令。所以我认为我的文件存在一些问题，然后我使用了这个命令正在运行的旧文件，但我看到同样的问题，如基因名称被转换为数字这里是完整的脚本：

countsTable<-read.table("JW.txt",header=TRUE,stringsAsFactors=TRUE,row.names=1)
mydata2 <- countsTable/1000
mydata3 <- data.frame(sapply(mydata2, as.integer))
str(mydata3)

请告诉我。

Answer 1

sapply适用于data.frame mydata2的列，并返回每列的相应输出。因此，它不会返回data.frame的行名，因此您必须重新分配这些行名，或者将新列数据重新分配到原始data.frame中，例如：

mydata2[] <- sapply(mydata2, as.integer)

因此，您可以保留所有原始属性。