使用python进行FWHM计算

时间:2018-03-04 21:38:51

标签: python analysis spectral

我正在尝试使用python计算光谱的FWHM。光谱描述(我在物理学方面谈论)对我而言有点复杂,我无法使用一些简单的高斯或洛里兹的轮廓拟合数据。

到目前为止,我设法管理数据的插值并绘制一条平行于X轴的直线到半最大值。

如何找到峰两侧两条线交点的坐标?

我知道如果我把光标放在这些点上它会给我坐标,但我想自动化这个过程,以便它变得更加用户友好。我怎么能这样做?

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2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

除了previos答案外,如果基线不为0,则((max-min)/ 2)+ min。那就是我解决我的问题的方法。谢谢。

答案 1 :(得分:0)

from matplotlib import pyplot as mp
import numpy as np

def peak(x, c):
    return np.exp(-np.power(x - c, 2) / 16.0)

def lin_interp(x, y, i, half):
    return x[i] + (x[i+1] - x[i]) * ((half - y[i]) / (y[i+1] - y[i]))

def half_max_x(x, y):
    half = max(y)/2.0
    signs = np.sign(np.add(y, -half))
    zero_crossings = (signs[0:-2] != signs[1:-1])
    zero_crossings_i = np.where(zero_crossings)[0]
    return [lin_interp(x, y, zero_crossings_i[0], half),
            lin_interp(x, y, zero_crossings_i[1], half)]

# make some fake data
x=np.linspace(0,20,21)
y=peak(x,10)

# find the two crossing points
hmx = half_max_x(x,y)

# print the answer
fwhm = hmx[1] - hmx[0]
print("FWHM:{:.3f}".format(fwhm))

# a convincing plot
half = max(y)/2.0
mp.plot(x,y)
mp.plot(hmx, [half, half])
mp.show()

这两个点的(x, y)坐标为(hmx[0], half)(hmx[1], half)