Question

最近，我决定从MATLAB移植到Matplotlib来绘制我的图表。在MATLAB中，我要做的只是转到文件＆gt; export＆gt; render然后选择600 dpi然后选择apply to figure然后导出。在Matplotlib中，我使用matplotlib库中的命令savefig作为

matplotlib.pyplot.savefig(fname, dpi=None, facecolor='w', edgecolor='w',
    orientation='portrait', papertype=None, format=None,
    transparent=False, bbox_inches=None, pad_inches=0.1,
    frameon=None).

然后我将dpi设置为600并将.tiff设置为输出格式。这工作正常，但文件非常大~32 MB。很明显，我不能在期刊手稿中使用这么大的文件。我想知道是否有办法将压缩合并到文件中，以便可以获得更小的图像文件而不会损失分辨率。

Answer 1

截至目前，无法为tiff格式添加压缩。有一个开放的issue和一个有效的solution，但自去年五月左右以来没有取得过进展。

在工作解决方案中，有一个建议的工作流程和引用

...用MPL生成巨大的TIFF图像文件，然后在PIL中导入它们，保存他们在PIL中使用压缩TIFF然后丢弃未压缩的TIFF文件。

scikit-image项目有一些tiff图片保存functionality并进行了压缩，根据您的使用情况，它可能对您有帮助。

除了tiff之外，期刊最有可能接受其他格式。然后你可以去png或jpeg，DPI为600，基本上可以用于期刊的所有目的。

Answer 2

从matplotlib版本3.1.0开始，现在可以directly pass parameters to PIL when saving a figure via the kwarg pil_kwarg：

import matplotlib.pyplot as plt

fig, ax = plt.subplots()

fig.savefig('/tmp/foo.tiff', dpi=600, format="tiff", pil_kwargs={"compression": "tiff_lzw"})

但是要小心输入错误，因为savefig似乎会默默地吞下不受支持的kwarg，例如pil_kwargssss ...

此功能是在this PR中引入的，它取代了PR linked by Ignacio Vergara Kausel in his response。

如何使用matplotlib以压缩600 dpi保存tiff中的数字？

2 个答案: