错误:包'BiocGenerics'的延迟加载失败

时间:2018-04-26 22:37:27

标签: r linux ubuntu quick-install-package

我正在尝试在R中安装此软件包“BiocGenerics”并收到此错误。

  

BioC_mirror:https://bioconductor.org使用Bioconductor 3.6   (BiocInstaller 1.28.0),R 3.4.2(2017-09-28)。安装包   'BiocGenerics'试用网址   'https://bioconductor.org/packages/3.6/bioc/src/contrib/BiocGenerics_0.24.0.tar.gz'   内容类型'application / x-gzip'长度43393字节(42 KB)   ==================================================下载了42 KB

     
      
  • 安装包'BiocGenerics'......   ** R.   ** inst   **准备延迟加载包为包'BiocGenerics'中的'append'创建一个新的泛型函数创建一个新的泛型函数   包'BiocGenerics'中的'as.data.frame'创建一个新的泛型   'BiocGenerics'包中的'cbind'函数错误:   相同(as.call(parse(text = old_code)[[1L]]),body [[7L]] [[3L]])是   apply_hotfix73465(getGeneric(“cbind”))中没有TRUE错误:修补程序   通用函数失败cbind()错误:无法加载R代码   package'BiocGenerics'ERROR:包的延迟加载失败   “BiocGenerics”
  •   
  • 删除'/home/hamna/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BiocGenerics'
  •   
     

下载的源包在     '/ tmp / RtmprEuKCy / downloaded_pa​​ckages'的安装路径没有   可写,无法更新包:BiocGenerics,littler,cluster,   foreign,MASS,Matrix,mgcv,nlme,rpart,survival警告信息:In   install.packages(pkgs = doing,lib = lib,...):安装   包'BiocGenerics'具有非零退出状态

我尝试过手动安装但是失败了。然后我在终端

上尝试了这个命令
  

sudo apt-get install r-bioc-biocgenerics

这对我有所帮助,但它安装的旧版本对我的最终包“hgu133plus2.db”无效

请帮忙! 最好,

1 个答案:

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Bioconductor支持网站上的

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R版本3.4.2存在问题,需要补丁。最好的解决方案是升级到至少3.4.3。

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