我正在尝试以org-mode编写报告。 从csv文件中读取数据(单列三行,浮点数),在条形图中进行比较,将图表嵌入报表中,以便将其导出到latex,然后导出为pdf。
我很难理解我在python代码的bar创建中所做的事情,因为R_plot工作正常,意味着图表在相同的org-mode下嵌入到报表中:export:results:file setting。
我在使用python代码做错了什么?如果我在交互模式下运行python代码,它会生成图表没有任何问题,但由于某种原因,当我运行cell-block时,py_comparison.png没有被保存。
#+NAME: R_plot
#+BEGIN_SRC R :exports both :results output graphics :file r_comparison.png
# graph in R
library("ggplot2")
performance <- read.csv("comparison.csv", header=FALSE)$V1
df <- data.frame(resource = c("1node1core", "1node8core", "2node8core"), performance = performance)
p <- ggplot(data = df, aes(x=resource, y=performance)) +
geom_bar(stat="identity", fill="steelblue") +
theme_minimal() +
ggtitle("Computation time (min) vs. Resource (type)")
p
#+END_SRC
#+NAME: python_plot
#+BEGIN_SRC python :exports both :results output graphics :file py_comparison.png
import matplotlib.pyplot as plt; plt.rcdefaults()
import matplotlib.pyplot as plt
import csv
objects = ['1node1core', '1node8core', '2node8core']
y_pos = list(range(0, len(objects)))
performance = []
with open('comparison.csv', newline='') as csvfile:
reader = csv.reader(csvfile)
for row in reader:
f_row = float(row[0])
performance.append(f_row)
plt.bar(y_pos, performance, align='center', alpha=0.5)
plt.xticks(y_pos, objects)
plt.ylabel('Time')
plt.title('Resource vs. Time')
plt.show()
#+END_SRC
答案 0 :(得分:2)
我相信你的python代码块的标头值是错误的。 :results <file name> file
和:file <file name>
之间存在差异。根据文件(为清晰起见,已编辑):
有四类:结果标头参数。每个'src'代码 block每个类只能选择一个选项。 [...]
收藏 [...]
- 值默认值。功能模式。结果是'src'代码块中最后一个语句返回的值。像Python这样的语言可能会 在'src'代码块中需要一个显式的return语句。用法 例如::结果值。
输入 [...]
- file解释为文件的路径。插入文件的链接。用法示例::结果值文件。
外部:保存代码执行结果的文件 块。 [...]某些语言,例如'R','dot','ditaa'和'gnuplot', 自动将源代码包装在其他样板代码中。 这种代码包装有助于重新创建输出,尤其是图形 输出,只执行:文件内容。
在python中,plt.show()
(或savefig
的结果)是None
,图像只是副作用,因此不会插入任何内容。在R中它可以工作,因为上面提到的样板包装
所以在python中你需要保存并返回你的图像而不是显示它。这样的事情应该有效:
#+NAME: python_plot
#+BEGIN_SRC python :results img.png file
import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot(range(5))
plt.savefig('img.png')
return 'img.png'
#+END_SRC