在ImageJ(斐济)上进行批量分析

时间:2018-06-21 13:31:23

标签: imagej

嗨,我有430个文件需要分析,它们在文件夹树中

我正在使用的插件是这个插件:http://dev.mri.cnrs.fr/projects/imagej-macros/wiki/Intensity_Ratio_Nuclei_Cytoplasm_Tool

需要将分析之前的文件转换为16位灰度图像,然后在其中一些文件上应用特定阈值(所有文件都具有相同的文件起始名称,例如DAPI.tif,DAPI 2.tif) 然后将每个DAPI X.tif转换为掩码,并使用该插件进行分析,并与另外两个文件(TRITC X.tif和FITC X.tif)进行分析,然后保存结果。

执行此操作的最佳方法是什么,因为手动进行此操作需要几个小时? 顺便说一句,我是imageJ的初学者,因此详细的说明将非常有用。

谢谢大家

1 个答案:

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请查看ImageJ Wiki的以下页面:

https://imagej.net/Batch

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