R中的规范分析

时间:2018-06-23 08:35:38

标签: r vegan

我正在使用以下代码在R中的vegan软件包中进行规范分析中的图。我得到的图是轴1和2的坐标。如何获得轴1和3的图。

library (vegan)  
e.data= read.csv (file.choose())
e.data.ca <- cca(e.data)
plot(scores(e.data.ca,display="sites"),type="p", cex=3*log(rowSums(e.data)/max(log(rowSums(e.data))))
text (scores(e.data.ca,display="sites"),row.names(e.data))

当我添加以下代码时:choices = c(1,3):

plot (scores(e.data.ca,display="sites"),type="p", choices=c(1,3),  cex=3*log(rowSums(e.data)/max(log(rowSums(e.data))))

我收到以下错误:

  

错误:出现意外符号:

"plot(scores(e.data.ca,display="sites"),type="p", choices=c(1,3),  cex=3*log(rowSums(e.data)/max(log(rowSums(e.data))))
    plot"

警告消息:

1: In plot.window(...) : "choices" is not a graphical parameter
2: In plot.xy(xy, type, ...) : "choices" is not a graphical parameter
3: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :

“选择”不是图形参数     4:在轴上(侧=侧,在=处,标签=标签,...):     “选择”不是图形参数     5:在box(...)中:“选择”不是图形参数     6:在title(...)中:“选择”不是图形参数

任何提示将不胜感激

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