用于循环操作的循环替代方案

时间:2011-02-24 15:58:32

标签: r time-series apply progressive

我必须逐步将回归函数应用于时间序列数据(向量“time”和“tm”,我使用For循环如下:

top<-length(time)
for(k in 2:top){
    lin.regr<-lm(tm[1:k] ~ log(time[1:k]))
    slope[k]<-coef(lin.regr)[2]
}

但是对于矢量长度约为10k,它变得非常慢。 是否有更快的替代方案(可能使用应用功能)?

一个更简单的问题:如果我有一个像x&lt; -c(1:10)这样的向量,我怎样才能构建一个包含(例如)x值渐进和的y向量? 像:

x
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
y
1  3  6 10 15 21 28 36 45 55

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

嗯,没有快速循环替代,除非你可以矢量化。在某些情况下,像ave, aggregate, ddply, tapply, ...这样的函数可以给你带来实质性的胜利,但通常的诀窍在于使用更快的函数,比如cumsum(cfr。用户615147的答案)

举例说明:

top <- 1000
tm <- rnorm(top,10)   
time <- rnorm(top,10)

> system.time(
+ results <- sapply(2:top,function (k) coef(lm(tm[1:k] ~ log(time[1:k])))[2])
+ )
   user  system elapsed 
   4.26    0.00    4.27 

> system.time(
+ results <- lapply(2:top,function (k) coef(lm(tm[1:k] ~ log(time[1:k])))[2])
+ )
   user  system elapsed 
   4.25    0.00    4.25 

> system.time(
+ results <- for(k in 2:top) coef(lm(tm[1:k] ~ log(time[1:k])))[2]
+ )
   user  system elapsed 
   4.25    0.00    4.25 

> system.time(
+ results <- for(k in 2:top) lm.fit(matrix(log(time[1:k]),ncol=1),
+                                 tm[1:k])$coefficients[2]
+ )
   user  system elapsed 
   0.43    0.00    0.42 

唯一更快的解决方案是lm.fit()。不要误会,每次运行分析时,时间差异都很大,因此在R中{0.02}的差异并不重要。sapply, forlapply在这里完全一样快。诀窍是使用lm.fit

如果您有一个名为Data的数据框,则可以使用以下内容:

Data <- data.frame(Y=rnorm(top),X1=rnorm(top),X2=rnorm(top))

mf <- model.matrix(Y~X1+X2,data=Data)
results <- sapply(2:top, function(k)
  lm.fit(mf[1:k,],Data$Y[1:k])$coefficients[2]
)

作为更通用的解决方案。

答案 1 :(得分:-1)

results <- sapply(2:top,function (k) coef(lm(tm[1:k] ~ log(time[1:k])))[2])

〜apply函数系列是在R中迭代的最快方法。

还可以看一下使用lm.fit()来加速你的注册

cumsum(1:10)

是如何做第二个问题