访问Snakefile中的命令行--jobs参数

时间:2018-07-17 15:16:05

标签: snakemake

是否有一种方法可以直接在Snakefile中运行snakemake时访问命令行中指定的--jobs(或-j)参数,而无需通过命令行分析(sys.argv,argparse等)?
有人会认为所有命令行参数都存储在可从Snakefile内访问的python对象中,但我无法找到关于它的任何文档。
我基本上是在尝试检索用户给出的作业数量,以在瓶颈脚本上使用其他并行化系统。
非常感谢。

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