(如何)我可以使用ddply总结按两个因素分组的数据帧?

时间:2018-09-05 12:45:40

标签: r aggregate plyr summarize

简短版本的问题: 如何使用ddply总结按几个变量分组的数据框?

我目前使用此代码按条件进行汇总:

ddply(ExampleData, .(Condition), summarize,  Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

如何调整代码以通过两个变量(“条件”和“块”)进行汇总?

所需的输出格式,例如:

  Condition Block Average SD  N Med
1         A     1    0.50 .. ..  ..
2         A     2    0.80 .. ..  ..
3         B     1    0.90 .. ..  ..
4         B     2    0.75 .. ..  ..

====

带有示例数据的较长版本的问题。

数据框:

ExampleData <- structure(list(Condition = c("A", "A", "A", "B", "B", "B"), Block = c(1, 
2, 1, 2, 1, 2), Var1= c(0.6, 0.8, 0.4, 1, 0.9, 0.5)), row.names = c(NA, 
6L), class = "data.frame")

这是:

  Condition Block Average SD N Med
1         A     1  0.6 
2         A     2  0.8
3         A     1  0.4
4         B     2  1.0
5         B     1  0.9
6         B     2  0.5

我意识到可以使用其他方法来获取摘要,但是如果我了解如何调整所拥有的功能,这将对我的学习很有帮助。 我只是没有成功使它起作用,因此我无法在Stackoverflow上找到帮助我的示例。我正在寻找类似的东西:

ddply(ExampleData, .c(Condition,Block), summarize,  Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

(或。(条件*块)或列表(条件,块)或... ??)

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

只需删除.variables参数中的c,那么您的代码就是:

library(plyr)
ddply(ExampleData, .(Condition, Block), summarize,  Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

顺便说一句,您可能想切换为使用dplyr而不是plyrhttps://blog.rstudio.com/2014/01/17/introducing-dplyr/

如果您要在dplyr中这样做:

summarize(group_by(ExampleData, Condition, Block), Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

您还可以使用管道系统,这样可以:

ExampleData %>% 
  group_by(Condition, Block) %>% 
  summarise(Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), 
            SD=sd(Var1),
            N=length(Var1), 
            Med =median(Var1))