我正在使用gganimate将动物跟踪数据叠加在猎物可用性上,并且两者都随着时间推移而动画化,以显示动物的运动随着猎物可用性的变化而变化。
跟踪数据集由
组成猎物数据集由
组成数据框示例
head(Tracks)
sumDur lon2 lat gmt
30641 0.0000000 -170.2978 57.10774 2004-08-18 05:05:00
29380 0.0000000 -170.3264 57.05684 2004-08-18 06:00:00
29381 10.0833333 -170.3565 57.00376 2004-08-18 07:00:00
29382 3.0833333 -170.3859 56.95370 2004-08-18 08:00:00
29383 0.8333333 -170.4147 56.90687 2004-08-18 09:00:00
29384 2.6666667 -170.4429 56.86301 2004-08-18 10:00:00
head(Prey)
# A tibble: 6 x 4
TotalEnergyM2 lat lon2 gmt
<dbl> <dbl> <dbl> <dttm>
1 0 50 160 2004-01-01 00:00:00
2 0 50 162. 2004-01-01 00:00:00
3 0.0000193 50 180. 2004-01-01 00:00:00
4 0 50.3 -151. 2004-01-01 00:00:00
5 38.3 53.9 -158 2004-01-01 00:00:00
6 31.4 53.9 -158. 2004-01-01 00:00:00
我已经能够在静态环境之上成功地对跟踪数据进行动画处理,并且还可以对没有跟踪数据的猎物数据进行动画处理。
我的问题在于尝试同时创建两个动画-我得到了一个动画,但是即使我知道时间重叠,每个动画的时间安排也不正确。
我认为这是由于我的时间列(gmt)的帧长在每个数据帧中不同而引起的;在我的跟踪数据框中,时间步长是一小时,在猎物数据框中,时间步长是一周。不幸的是,我无法验证这一点,因为猎物数据帧太大,无法将其复制到一个小时的时间步长。我一直在尝试一些不同的转换(例如transition_state
),但没有成功,也无法在这里或其他地方找到任何解决方案。
如果我没有提供足够的信息或格式已关闭,我们将不胜感激,并且会提前道歉,这是我的第一篇帖子。
plot <- ggplot(NULL) +
geom_raster(data=Prey, aes(x=lon2, y=lat2, fill=TotalEnergyM2) +
geom_point(data=Tracks, aes(x=lon2, y=lat2, size=sumDur)) +
scale_fill_viridis_c()+
transition_time(gmt)+
ease_aes("linear")+
labs(title="{frame_time}", x="Longitude", y="Latitude")
animate(plot)
如果我注释掉geom_raster或geom_point以便获得单独的动画,或者geom_raster是静态的,则上面的代码可以完美地工作。我已经将两个带有假数据的数据文件的链接附加到了上面的代码中,并重现了我遇到的问题datafiles。
答案 0 :(得分:0)
在我的机器上,您的代码运行没有问题。如果您的datetime
的格式正确地设置为日期transition_time()
,则将填补数据点之间的所有空白:
plot <- ggplot() +
geom_raster(data = Prey, aes(x = lon, y = lat, fill = energy)) +
scale_fill_viridis_c() +
geom_point(data = Tracks, aes(x = lon, y = lat, size = sumdur)) +
transition_time(datetime) +
ease_aes("linear") +
labs(title="{frame_time}", x="Longitude", y="Latitude")
animate(plot, nframes = 100)