程序在pycharm中完美运行，在终端中运行时给出错误答案

Question

背景。四年制Comp Sci学生。第一年的python。

  

问题：我在两个地方运行程序，Pycharm（IDE）和使用终端的外部服务器。相同python的输出   在这两件事上运行时，文件是不同的。我需要它   相同，最好是正确的。 （是的，python和fasta文件   在终端和Pycharm上是相同的。

pycharm和终端上的文件。

Pycharm文件：

1. chromosome9.fa
2. Window.py
3. 要运行的命令：python Window.py染色体9.fa

终端文件

1. chrom9.fa
2. Window.py
3. 要运行的命令：python Window.py chrom9.fa

Pycharm文件的输出

There are 1255728 CpG pairs in this sequence.


[(63385200, 63385679), (64711680, 64712169), (65825370, 65825849), (131739850, 131740259), (134326260, 134326859)]

[(1092400, 1092839), (1366440, 1366849), (1549650, 1550099), (4068100, 4068849), (4326450, 4327169), (9216770, 9217449), (12647450, 12648029), (14136430, 14136909), (15126110, 15126569)
, (29073770, 29074689), (39586690, 39587139), (73198340, 73198929), (74377730, 74378379), (75009180, 75009779), (75341380, 75341889), (99970290, 99970769), (103436370, 103436809)]

getting average CpGIsland length for + strand
Average length: 491.0

getting average CpGIsland length for - strand
Average length: 564.2941176470588

终端程序的输出

('There are', 1255728, 'CpG pairs in this sequence.')

[]

[]


getting average CpGIsland length for + strand
Average length : 0

getting average CpGIsland length for - strand
Average length : 0

打印声明

print("There are",len(CG_indices),"CpG pairs in this sequence.")

两者的打印方式也有所不同，但我目前不在乎。

有人知道发生了什么事吗？

Answer 1

天哪，你们都很好。是的，我在终端上运行了python3 Window.py chrom9.fa，它起作用了，而当我运行python Window.py chrom9.fa时却不起作用。你们太棒了！感谢Graipher Ian Quah的怪异行为。 （Aaaaaaaaaaaaaa）（内部尖叫）

仍然不知道为什么会这样，但是我现在知道那显然是一个非常严重的问题。