使用OWL API将类子层次结构合并到另一个本体

时间:2018-12-17 11:28:31

标签: owl owl-api

我有两个本体,分别称为本体A和本体B。简而言之,我需要在本体A中获得带有其子概念(概念的子层次结构)的概念C1,并将其合并到本体B中的概念。在OWL API中是否有实现此目标的简便方法?这个逻辑从头开始?

我已经研究了其他一些相关问题,但是它们不包含我所需要的。 Protege仅包含合并两个本体的选项,而这并不是我的要求(Merge Ontology with Protege-OWL API)。我发现的有关合并本体的问题也可以合并完整的本体(How to properly merge 2 ontologies with OWL API 4 or 3.5)。我想要的是将本体的一部分合并到另一个本体中。

很简单,OWL API中是否有一种简单的方法可以将本体的一部分(概念的子层次结构)合并到另一个本体中?

谢谢。

1 个答案:

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这个问题看似简单,但是在编写代码之前,需要明确一些重要的约束条件。

本体中的子层次结构很简单,即仅命名类,而命名类之间只有子类公理:

A subclassOf B
C subclassOf B

这两个公理完全描述了B的子层次结构,因此您可以选择它们并轻松进行复制:

OWLOntology source = ...
OWLOntology destination = ...
OWLClass a = ...

source.subClassAxiomsForSuperClass(a).forEach(destination::addAxiom);
// repeat on the subclass in each axiom recursively

但是,如果有匿名类,问题将迅速变得更加复杂:

A subclassOf exist r D
exist r D subclassOf B
C subclassOf B

如果有必要保留所有推论和断言的层次结构(例如,上面示例中显示的GCI),则选择要复制到目标本体的公理集将变得非常复杂。 有大量关于模块化和原子分解的文献,这两个研究领域都涉及选择公理的主题,该公理允许所有引用初始签名的推论-在这种情况下,是您的入门班。

您可以使用SyntacticLocalityModuleExtractor获取公理集:

destination.addAxioms(new SyntacticLocalityModuleExtractor(
        source.getOWLOntologyManager(), 
        source, 
        ModuleType.STAR));

但是,您应该阅读文献中的相关文章,以了解可用方法的优点和局限性。一些起点:

http://owl.cs.manchester.ac.uk/research/modularity/

http://www.cs.man.ac.uk/~delvescc/dl-10.pdf

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3113511/