在快速的本地集群上管理工作人员内存

时间:2018-12-26 19:20:16

标签: python pandas dask

我试图用dask加载数据集,但是当需要计算我的数据集时,我总是遇到这样的问题:

  

警告-工作者超出了95%的内存预算。重新启动。

我只是在本地计算机上工作,因此开始执行以下操作:

if __name__ == '__main__':
    libmarket.config.client = Client()  # use dask.distributed by default

现在,在错误消息中,我一直看到对“ memory_limit =”关键字参数的引用。但是,我已经彻底搜索了dask文档,无法弄清楚如何在单机配置中增加流血的worker内存限制。我有256GB的RAM,在将其转换回pandas数据帧之前,我将删除将来的大多数列(20GB的csv文件),因此我知道它将适合内存。我只需要从代码中增加每个工作人员的内存限制(不使用dask-worker),以便可以对其进行处理。

请,有人帮助我。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

自变量memory_limit可以提供给__init()__Client的{​​{1}}函数。

一般性言论

仅调用LocalCluster是先调用Client(),然后再使用创建的集群(Dask: Single MachineLocalCluster()的快捷方式。当在没有Client实例的情况下调用Client时,可以将LocalCluster的所有可能参数提供给LocalCluster.__init()__的初始化调用。因此,Client类的API文档中未记录参数memory_limit(以及其他参数,例如n_workers)。

但是,似乎Client的API文档中没有正确记录参数memory_limit(请参见Dask GitHub Issue #4118)。

解决方案

一个工作示例如下。我添加了更多参数,这可能对发现此问题/答案的人们很有用。

LocalCluster

快捷方式应该是

# load/import classes
from dask.distributed import Client, LocalCluster

# set up cluster and workers
cluster = LocalCluster(n_workers=4, 
                       threads_per_worker=1,
                       memory_limit='64GB')
client = Client(cluster)

# have a look at your workers
client

# do some work
## ... 

# close workers and cluster
client.close()
cluster.close()

进一步阅读

相关问题