如何将矩阵列作为参数传递给.apply函数?

时间:2019-02-11 10:18:56

标签: r apply

我想一次将多个参数传递给一个函数,其中这些参数是包含在这样的矩阵中的向量:

> head(M, 3)
           [,1]      [,2]       [,3]
[1,]  1.3709584  1.304870 -0.3066386
[2,] -0.5646982  2.286645 -1.7813084
[3,]  0.3631284 -1.388861 -0.1719174

例如,考虑使用cor(),以下行给出了我想要的内容,但我不想嵌套。

> sapply(1:3, function(x) sapply(1:3, function(y, ...) cor(M[, x], M[, y])))
           [,1]       [,2]       [,3]
[1,]  1.0000000 -0.3749289  0.4400510
[2,] -0.3749289  1.0000000 -0.1533438
[3,]  0.4400510 -0.1533438  1.0000000

我认为outer()将是候选人,因为:

> outer(1:3, 1:3, function(x, y) x + y)
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    2    3    4
[2,]    3    4    5
[3,]    4    5    6

但是

corFun <- function(x, y) cor(M[, x], M[, y])
outer(1:3, 1:3, corFun)

不起作用。 mapply(corFun, M[, 1], M[, 2])次尝试也不起作用。

我想做xFun(corFun, M, arg)甚至做得更好的xFun(cor, M, arg)(如上):

           [,1]       [,2]       [,3]
[1,]  1.0000000 -0.3749289  0.4400510
[2,] -0.3749289  1.0000000 -0.1533438
[3,]  0.4400510 -0.1533438  1.0000000

其中arg <- combn(1:3, 2)arg <- t(expand.grid(1:3, 1:3))

一般来说,我想知道是否有一个现有的基本R函数,例如xFun(FUN, ..., arg),它将带有arg的参数矩阵dim(arg)[1] == 2传递给列函数FUN = function(x, y),或者甚至更一般的dim(arg)[1] == length(formals(FUN))


数据:

set.seed(42)
M <- matrix(rnorm(30), 10, 3)

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

outer是您的职能,但您只需要Vectorize您的corfun

outer(1:3, 1:3, Vectorize(corFun))
#           [,1]       [,2]       [,3]
#[1,]  1.0000000 -0.3749289  0.4400510
#[2,] -0.3749289  1.0000000 -0.1533438
#[3,]  0.4400510 -0.1533438  1.0000000

答案 1 :(得分:3)

另一个选项是combn

combn(1:3, m = 3, FUN = corFun)[,, 1]
#           [,1]       [,2]       [,3]
#[1,]  1.0000000 -0.3749289  0.4400510
#[2,] -0.3749289  1.0000000 -0.1533438
#[3,]  0.4400510 -0.1533438  1.0000000

但是结果是一个数组,因此是[,, 1]