Question

输入：

bta01524 Platinum drug resistance - Bos taurus (cow) (1)

  bta:514386 BIRC3

bta01522 Endocrine resistance - Bos taurus (cow) (2)

  bta:280795 FOS
  bta:281848 IGF1R

所需的输出：

bta01524 BIRC3
bta01522 FOS 
bta01522 IGF1R

我一直在尝试以下代码，但无法删除bta：

sed 's%/\bta:/b[^ ]*%%g' output.txt

Answer 1

如果行不是以空格（/^[^ ]/开头），则将第一列保存到变量save中。如果行以空格（/^ /开头并且包含列（NF!=0），则打印变量save和列2的内容。

awk '/^[^ ]/ {save=$1}; /^ / && NF!=0 {print save,$2}' file

输出：

bta01524 BIRC3
bta01522 FOS
bta01522 IGF1R

Answer 2

除了sed，awk还可以为您的问题提供一个很好的解决方案，例如

awk '/^\w/{lbl=$1;next} NF>1{print lbl,$NF}' file

说明

规则1-/^\w{lbl=$1;next}（如果第一个字符是\w（单词字符），则将标签（lbl）设置为第一个字段并获取next记录;
规则2-NF>1{print lbl,$NF}，如果字段数（NF）大于1，则打印标签和最后一个字段。

（注意：，'\w'单词速记需要GNU awk，相当于[a-zA-Z0-9_]）

使用/输出示例

使用您在file中的输入

$ awk '/^\w/{lbl=$1;next} NF>1{print lbl,$NF}' file
bta01524 BIRC3
bta01522 FOS
bta01522 IGF1R

Answer 3

这可能对您有用（GNU sed）：

sed -En '/^\S/h;//d;G;s/^.*\s(\S+)\n(\S+).*/\2 \1/p' file

如果当前行以非空白开头，请在保留空间中进行复制，然后将其删除。否则，将保留空间附加到当前行，并使用模式匹配和反向引用来调整所需的格式。如果成功，则打印结果。

设置选项-n可以防止正常打印并复制 grep-like 性质。

匹配后删除字符串，并排除空换行符

3 个答案: