我正在尝试使用Spark_Apply运行coxph()生存函数,但出现错误
Error in file(con, "r") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(con, "r") :
cannot open file 'C:\Users\XXXX\AppData\Local\Temp\1\Rtmpusw8Aw\file344868ef1e07_spark.log': Permission denied
每当我输入错误的R命令时,我都会看到此错误,但是在这种情况下,我的coxph命令在R中可以正常工作
具有线性回归参考的Spark_Apply https://spark.rstudio.com/
我知道spark_apply只是尝试尽可能多地分发数据。在我的问题中,我想知道我做错了或spark_apply canot运行生存模型,或者我是否需要通过任何方式导入生存函数以使用sparklrR。
R代码:
coxph(Surv(t_start, t_stop, t_trans)~1,data_input)
O / p:
Null model
log likelihood= -XXX
n= XX
Sparklr代码:
data<-copy_to(sc,data_input)
spark_apply(
data,
function(e) coxph(Surv(t_start, t_stop, t_trans)~1,e),
)
O / p:
Error in file(con, "r") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(con, "r") :
cannot open file 'C:\Users\XXXX\AppData\Local\Temp\1\Rtmpusw8Aw\file344868ef1e07_spark.log': Permission denied