Question

我目前正在努力运行要尝试从 Jenkins 触发的.sh脚本。

在 Jenkins “执行外壳”部分中，我正在连接到远程服务器（ Jenkins 代理没有正确的操作系统来构建所需的操作系统。），使用：

cp -r . /to/shared/drive/to/have/access/on/remote
ssh -t -t username@servername << EOF
    cd /to/shared/drive/to/have/access/on/remote
    source build.sh dev
    exit
EOF

在build.sh内部，我正在导出R_LIBS来为不同的 R 版本构建软件包。

...
for path in "${!rVersionPaths[@]}"; do
    export R_LIBS="${path}"
    Rscript -e 'install.packages(c("someDependency", "someOtherDependency"), repos="http://cran.r-project.org");'
...

此处设置R_LIBS的功能类似于在lib中设置install.packages(...)。由于某些原因，R_LIBS export未被使用。同样设置其他环境变量，例如http_proxy也会被忽略。这会导致网络外部的任何请求失败。

有没有实现这一目标的特殊方法？

Answer 1

也许可以通过env传递这些变量，例如

env R_LIBS="${path}" Rscript -e 'install.packages(c("someDependency", .....

Answer 2

好吧，我无法对此问题发表评论，因此请将其发布为答案。

从Jenkins调用远程shell脚本时，我遇到了类似的问题，问题是从Jenkins调用脚本时，以某种方式未加载bash_profile变量，但在本地它起作用。在ssh连接中加载bash配置文件为我解决了该问题。

将源代码添加到build.sh中的bash_profile

. ~/.bash_profile或source ~/.bash_profile

或在SSH连接中重新加载bash_profile

`ssh -t -t username@servername << EOF
   . ~/.bash_profile
   your commands here
   exit
EOF

Answer 3

您可以在同一命令行中设置该变量，如下所示：

R_LIBS="${path}" Rscript -e \
    'install.packages(c("someDependency", "someOtherDependency"), repos="http://cran.r-project.org");'

可以通过这种方式附加更多变量。请注意，这只会为在它们之后被调用的命令（以及它的子进程）设置那些环境变量。

Answer 4

您说“ R_LIBS export未被捡起”。问题值是UNSET吗？还是将其设置为其他值，而您正在尝试覆盖它？

SSH可能正在调用“ / bin / sh -c”。根据第二个答案：Why does 'cd' command not work via SSH?，您可以简化SSH命令并在Bash中显式调用build.sh脚本：

cp -r . /to/shared/drive/to/have/access/on/remote
ssh -t -t username@servername "cd /to/shared/drive/to/have/access/on/remote && bash -f build.sh dev"

这使SSH调用与在远程交互式Shell中调用命令更加相似。（您可以避免采购脚本和导出变量。）

如果可以在任何命令前加上局部环境变量覆盖（与Luis的回答一致），则无需export R_LIBS或env R_LIBS：

...
for path in "${!rVersionPaths[@]}"; do
    R_LIBS="${path}" Rscript -e 'install.packages(c("someDependency", "someOtherDependency"), repos="http://cran.r-project.org");'
...

Rscript可能在env var方面做了很多工作。您可以通过用R_LIBS命令替换Rscript来验证您正在设置env环境变量，并观察输出：

...
for path in "${!rVersionPaths[@]}"; do
    R_LIBS="${path}" env
...

根据本手册“ Initialization at Start of an R Session”，Rscript会在多个位置加载“站点和用户文件”：

$ R_PROFILE
$ R_HOME / etc / Renviron
$ R_HOME / etc / Renviron.site
$ R_ENVIRON_USER
$ R_PROFILE_USER
./ .. Rprofile
$ HOME / .Rprofile
./。RData

该手册的“示例”部分显示了以下内容：

## Not run: 
## Example ~/.Renviron on Unix
R_LIBS=~/R/library
PAGER=/usr/local/bin/less

如果您添加--vanilla命令行选项来忽略所有这些文件，那么您可能会得到不同的结果，并且知道site / init / environ文件中的某些内容正在影响您的R_LIBS！我自己无法运行此系统。希望我们能给您一些方面进行调查。

Answer 5

您可能不想from selenium.webdriver.support import expected_conditions as EC from selenium.webdriver.common.by import By from selenium.webdriver.support.ui import WebDriverWait，只需直接调用它即可（即删除source build.sh命令）。

通过source-写入文件，您的脚本将在SSH Shell中执行（可能是source），而不是由sh执行，这听起来像是您想要的。

无法从脚本导出环境变量

5 个答案: