我一直在使用利用metaMS和xcms查看GCMS CDF文件的脚本。我假设该脚本很好,因为我实际上只是在数据库文件开始引发错误之前对其进行了更改。
此后,我将数据库文件恢复为以前的版本,尝试了脚本的早期迭代,重新安装了R和R studio,随后重新安装了BiocManager以重新安装metaMS和xcms,但无济于事。
MSnbase和rtools特别麻烦,说我需要rtools来安装软件包,但是rtools与我的R版本不兼容(我正在使用R 3.6和R Studio 1.2.1335-我愿意更新但这通常会导致某些程序包出现问题,因此我试图避免这种情况。)
我什至试图以管理员身份重新安装,但仍然无法正常工作。
我将提供我遇到的各种错误的图像。
如果您有任何想法,我欢迎他们。我完全不知所措。
P.S。我肯定在安装依赖项。我尝试通过命令行和安装程序进行安装。