Java中的高效Fisher精确测试

Question

我需要一个库/函数/方法在Java中执行Fisher精确测试，并提供右，左和双尾概率。 简单的谷歌搜索在Tassel的包中显示了一个解决方案，但是里面的方法只是在没有优化的情况下应用测试步骤，因此它非常慢。而且，它在任何地方都使用int类型，对于大型列联表来说它并不是真正有效。

如果您知道任何已编写的解决方案，请帮助我： - ）

Answer 1

看看这是否有帮助：http://www.users.zetnet.co.uk/hopwood/tools/StatTests.java

formula非常简单。这里有一个非常简单的（双尾）实现：http://javanus.com/blogs/?p=51（请参阅Discretoboy的评论，以获得更清晰的实现）

您还可以查看Java统计类中的test implementation。

Answer 2

我使用http://wordhoard.northwestern.edu/userman/javadoc/edu/northwestern/at/utils/math/statistics/FishersExactTest.html

一个（非常）简短的测试显示它与上面提到的Java统计类（jsc）测试的速度相似但是当我的表包含零时，它还有一个额外的优点就是不给我一个非法的参数异常，我相信是一个合法的案例。