我在 R 图形库 (https://www.r-graph-gallery.com/79-levelplot-with-ggplot2.html) 中找到了以下用于热图的 R 代码并对其进行了一些修改:
# Library
library(ggplot2)
set.seed(10)
# Dummy data
x <- LETTERS[1:20]
y <- paste0("var", seq(1,20))
data <- expand.grid(X=x, Y=y)
data$Z <- runif(400, -1, 2)
print (data)
# Heatmap
ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) +
geom_tile(color = "white",
lwd = 0.5,
linetype = 1)
我的问题:我有三列,值范围从 -1 到 2。现在我想为这些值分配定义的颜色,例如如下: -1:红色,0:绿色,1:黄色,2:蓝色。
有没有办法使用 geom_tile 函数来解决我的问题?
谢谢!
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如果你想有离散的间隔和尺度,你应该把 df$Z
的值转化为整数因子,然后使用 scale_fill_manual
来获得所需的配色方案。
data$Z <- factor(round(data$Z))
# Heatmap
ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) +
geom_tile(color = "white",
lwd = 0.5,
linetype = 1)+
scale_fill_manual(values = c('red', 'green', 'yellow', 'blue'))
#or simply
ggplot(data, aes(X, Y, fill= factor(round(data$Z)))) +
geom_tile(color = "white",
lwd = 0.5,
linetype = 1)+
scale_fill_manual(values = c('red', 'green', 'yellow', 'blue'), name = 'Z')
要将 Z 值转换为字符串,您可以使用:
library(plyr)
data$Z <- factor(round(data$Z))
ata$Z <- revalue(data$Z, c('-1'='negative'))
data$Z <- revalue(data$Z, c('0' = 'no'))
data$Z <- revalue(data$Z, c('1' = 'yes'))
data$Z <- revalue(data$Z, c('2' = 'other'))
# Heatmap
ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) +
geom_tile(color = "white",
lwd = 0.5,
linetype = 1)+
scale_fill_manual(values = c('red', 'green', 'yellow', 'blue'), name = 'Z')
答案 1 :(得分:0)