屏幕与mpirun

Question

MPI工作正常：

$ mpirun -np 2 -H compute-0-0,compute-0-1 echo 1
1
1

然而，当通过屏幕启动时它不起作用：

$ rm -f screenlog.*
$ screen -L mpirun -np 2 -H compute-0-0,compute-0-1 echo 1
[screen is terminating]
$ cat screenlog.0 
mpirun: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory

这没有用：

$ rm -f screenlog.*
$ screen -L `which mpirun` -xLD_LIBRARY_PATH -np 2 -H compute-0-0,compute-0-1 echo 1
[screen is terminating]
$ cat screenlog.0 
/share/apps/intel/openmpi/bin/mpirun: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory

Answer 1

（这是一个Rocks群？）

显然，由于某种原因，你没有得到正确的$LD_LIBRARY_PATH。

这不是一个非常干净的解决方案，但它应该有效：

$ screen -L env LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH mpirun -np 2 \
  -H compute-0-0,compute-0-1 echo 1

我认为这是你试图用-xLD_LIBRARY_PATH选项做的事情，但我没有在documentation中看到我能找到的。

这就是你试图用-xLD_LIBRARY_PATH选项做的事情，但这只会从$LD_LIBRARY_PATH调用的进程中获取screen的值（并传递给它）到echo 1命令。到那时为时已晚。此外，man page表明应该有一个空格：-x LD_LIBRARY_PATH;我不知道是否需要。

是否有一些脚本要为MPI获取环境（包括$LD_LIBRARY_PATH）？它是在您的登录shell启动时自动获取的，还是您手动执行？您可能希望编写一个小的包装器脚本来源安装脚本，然后调用指定的命令。像（未经测试）的东西：

#!/bin/sh
. /share/apps/intel/openmpi/etc/setup.sh # probably not the right name
exec "$@"

将其另存为$HOME/bin/mpienv.sh，然后您可以使用：

$ screen -L mpienv.sh mpirun -np 2 -H compute-0-0,compute-0-1 echo 1